Protein–RNA interactions for Protein: Q497L1

H2al1n, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1nQ497L1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2al1nQ497L1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2al1nQ497L1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2al1nQ497L1 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2al1nQ497L1 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2al1nQ497L1 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2al1nQ497L1 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2al1nQ497L1 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2al1nQ497L1 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2al1nQ497L1 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2al1nQ497L1 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2al1nQ497L1 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2al1nQ497L1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2al1nQ497L1 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2al1nQ497L1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2al1nQ497L1 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2al1nQ497L1 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2al1nQ497L1 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2al1nQ497L1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2al1nQ497L1 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2al1nQ497L1 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2al1nQ497L1 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2al1nQ497L1 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2al1nQ497L1 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2al1nQ497L1 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2al1nQ497L1 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2al1nQ497L1 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2al1nQ497L1 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2al1nQ497L1 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2al1nQ497L1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2al1nQ497L1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2al1nQ497L1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2al1nQ497L1 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2al1nQ497L1 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2al1nQ497L1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
H2al1nQ497L1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2al1nQ497L1 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2al1nQ497L1 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2al1nQ497L1 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2al1nQ497L1 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
H2al1nQ497L1 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2al1nQ497L1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2al1nQ497L1 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2al1nQ497L1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2al1nQ497L1 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2al1nQ497L1 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2al1nQ497L1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2al1nQ497L1 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2al1nQ497L1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2al1nQ497L1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2al1nQ497L1 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2al1nQ497L1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
H2al1nQ497L1 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
H2al1nQ497L1 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
H2al1nQ497L1 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
H2al1nQ497L1 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
H2al1nQ497L1 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2al1nQ497L1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
H2al1nQ497L1 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
H2al1nQ497L1 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
H2al1nQ497L1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2al1nQ497L1 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2al1nQ497L1 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
H2al1nQ497L1 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2al1nQ497L1 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2al1nQ497L1 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2al1nQ497L1 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
H2al1nQ497L1 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2al1nQ497L1 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2al1nQ497L1 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2al1nQ497L1 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2al1nQ497L1 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.07■□□□□ 0
H2al1nQ497L1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2al1nQ497L1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2al1nQ497L1 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2al1nQ497L1 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2al1nQ497L1 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
H2al1nQ497L1 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.06■□□□□ 0
H2al1nQ497L1 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2al1nQ497L1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2al1nQ497L1 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2al1nQ497L1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2al1nQ497L1 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2al1nQ497L1 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
H2al1nQ497L1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
H2al1nQ497L1 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
H2al1nQ497L1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
H2al1nQ497L1 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
H2al1nQ497L1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2al1nQ497L1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
H2al1nQ497L1 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2al1nQ497L1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2al1nQ497L1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC15.05■□□□□ -0
H2al1nQ497L1 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2al1nQ497L1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2al1nQ497L1 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2al1nQ497L1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2al1nQ497L1 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2al1nQ497L1 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2al1nQ497L1 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms