Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZT31

Snx25, Sorting nexin-25, mousemouse

Predictions only

Length 840 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx25Q3ZT31 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snx25Q3ZT31 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snx25Q3ZT31 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snx25Q3ZT31 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Snx25Q3ZT31 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snx25Q3ZT31 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snx25Q3ZT31 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snx25Q3ZT31 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Snx25Q3ZT31 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snx25Q3ZT31 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snx25Q3ZT31 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snx25Q3ZT31 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snx25Q3ZT31 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snx25Q3ZT31 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snx25Q3ZT31 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snx25Q3ZT31 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snx25Q3ZT31 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Snx25Q3ZT31 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Snx25Q3ZT31 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Snx25Q3ZT31 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Snx25Q3ZT31 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Snx25Q3ZT31 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Snx25Q3ZT31 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Snx25Q3ZT31 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Snx25Q3ZT31 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Snx25Q3ZT31 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Snx25Q3ZT31 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Snx25Q3ZT31 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Snx25Q3ZT31 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Snx25Q3ZT31 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Snx25Q3ZT31 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Snx25Q3ZT31 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Snx25Q3ZT31 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Snx25Q3ZT31 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Snx25Q3ZT31 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Snx25Q3ZT31 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Snx25Q3ZT31 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Snx25Q3ZT31 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Snx25Q3ZT31 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Snx25Q3ZT31 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Snx25Q3ZT31 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Snx25Q3ZT31 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Snx25Q3ZT31 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Snx25Q3ZT31 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Snx25Q3ZT31 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Snx25Q3ZT31 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Snx25Q3ZT31 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Snx25Q3ZT31 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Snx25Q3ZT31 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Snx25Q3ZT31 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Snx25Q3ZT31 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Snx25Q3ZT31 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Snx25Q3ZT31 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Snx25Q3ZT31 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Snx25Q3ZT31 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Snx25Q3ZT31 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Snx25Q3ZT31 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Snx25Q3ZT31 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Snx25Q3ZT31 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Snx25Q3ZT31 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Snx25Q3ZT31 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Snx25Q3ZT31 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Snx25Q3ZT31 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Snx25Q3ZT31 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Snx25Q3ZT31 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Snx25Q3ZT31 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Snx25Q3ZT31 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Snx25Q3ZT31 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Snx25Q3ZT31 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Snx25Q3ZT31 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Snx25Q3ZT31 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Snx25Q3ZT31 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Snx25Q3ZT31 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Snx25Q3ZT31 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Snx25Q3ZT31 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Snx25Q3ZT31 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Snx25Q3ZT31 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snx25Q3ZT31 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snx25Q3ZT31 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snx25Q3ZT31 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snx25Q3ZT31 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snx25Q3ZT31 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snx25Q3ZT31 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snx25Q3ZT31 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snx25Q3ZT31 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snx25Q3ZT31 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Snx25Q3ZT31 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snx25Q3ZT31 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snx25Q3ZT31 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snx25Q3ZT31 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snx25Q3ZT31 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snx25Q3ZT31 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snx25Q3ZT31 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snx25Q3ZT31 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Snx25Q3ZT31 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Snx25Q3ZT31 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Snx25Q3ZT31 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Snx25Q3ZT31 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Snx25Q3ZT31 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Snx25Q3ZT31 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms