Protein–RNA interactions for Protein: Q3V2G9

1810049J17Rik, RIKEN cDNA 1810049J17 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1810049J17RikQ3V2G9 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
1810049J17RikQ3V2G9 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
1810049J17RikQ3V2G9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
1810049J17RikQ3V2G9 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
1810049J17RikQ3V2G9 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
1810049J17RikQ3V2G9 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
1810049J17RikQ3V2G9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
1810049J17RikQ3V2G9 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
1810049J17RikQ3V2G9 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
1810049J17RikQ3V2G9 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
1810049J17RikQ3V2G9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
1810049J17RikQ3V2G9 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
1810049J17RikQ3V2G9 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
1810049J17RikQ3V2G9 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
1810049J17RikQ3V2G9 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
1810049J17RikQ3V2G9 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
1810049J17RikQ3V2G9 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
1810049J17RikQ3V2G9 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
1810049J17RikQ3V2G9 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
1810049J17RikQ3V2G9 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
1810049J17RikQ3V2G9 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
1810049J17RikQ3V2G9 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
1810049J17RikQ3V2G9 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
1810049J17RikQ3V2G9 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
1810049J17RikQ3V2G9 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
1810049J17RikQ3V2G9 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
1810049J17RikQ3V2G9 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
1810049J17RikQ3V2G9 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
1810049J17RikQ3V2G9 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
1810049J17RikQ3V2G9 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
1810049J17RikQ3V2G9 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
1810049J17RikQ3V2G9 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
1810049J17RikQ3V2G9 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
1810049J17RikQ3V2G9 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
1810049J17RikQ3V2G9 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
1810049J17RikQ3V2G9 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
1810049J17RikQ3V2G9 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
1810049J17RikQ3V2G9 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
1810049J17RikQ3V2G9 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
1810049J17RikQ3V2G9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
1810049J17RikQ3V2G9 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
1810049J17RikQ3V2G9 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
1810049J17RikQ3V2G9 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
1810049J17RikQ3V2G9 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
1810049J17RikQ3V2G9 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
1810049J17RikQ3V2G9 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
1810049J17RikQ3V2G9 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
1810049J17RikQ3V2G9 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
1810049J17RikQ3V2G9 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
1810049J17RikQ3V2G9 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
1810049J17RikQ3V2G9 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
1810049J17RikQ3V2G9 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
1810049J17RikQ3V2G9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
1810049J17RikQ3V2G9 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
1810049J17RikQ3V2G9 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
1810049J17RikQ3V2G9 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
1810049J17RikQ3V2G9 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
1810049J17RikQ3V2G9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
1810049J17RikQ3V2G9 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
1810049J17RikQ3V2G9 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
1810049J17RikQ3V2G9 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
1810049J17RikQ3V2G9 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
1810049J17RikQ3V2G9 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
1810049J17RikQ3V2G9 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
1810049J17RikQ3V2G9 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
1810049J17RikQ3V2G9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
1810049J17RikQ3V2G9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
1810049J17RikQ3V2G9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
1810049J17RikQ3V2G9 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
1810049J17RikQ3V2G9 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
1810049J17RikQ3V2G9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
1810049J17RikQ3V2G9 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
1810049J17RikQ3V2G9 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
1810049J17RikQ3V2G9 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
1810049J17RikQ3V2G9 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
1810049J17RikQ3V2G9 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
1810049J17RikQ3V2G9 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
1810049J17RikQ3V2G9 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
1810049J17RikQ3V2G9 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
1810049J17RikQ3V2G9 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
1810049J17RikQ3V2G9 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
1810049J17RikQ3V2G9 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
1810049J17RikQ3V2G9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
1810049J17RikQ3V2G9 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
1810049J17RikQ3V2G9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
1810049J17RikQ3V2G9 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
1810049J17RikQ3V2G9 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
1810049J17RikQ3V2G9 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
1810049J17RikQ3V2G9 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
1810049J17RikQ3V2G9 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
1810049J17RikQ3V2G9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
1810049J17RikQ3V2G9 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
1810049J17RikQ3V2G9 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
1810049J17RikQ3V2G9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
1810049J17RikQ3V2G9 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
1810049J17RikQ3V2G9 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
1810049J17RikQ3V2G9 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
1810049J17RikQ3V2G9 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
1810049J17RikQ3V2G9 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
1810049J17RikQ3V2G9 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms