Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H1

Ckap2, Cytoskeleton-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2Q3V1H1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ckap2Q3V1H1 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ckap2Q3V1H1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ckap2Q3V1H1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ckap2Q3V1H1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ckap2Q3V1H1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ckap2Q3V1H1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ckap2Q3V1H1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ckap2Q3V1H1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ckap2Q3V1H1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ckap2Q3V1H1 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Ckap2Q3V1H1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ckap2Q3V1H1 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Ckap2Q3V1H1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Ckap2Q3V1H1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ckap2Q3V1H1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ckap2Q3V1H1 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ckap2Q3V1H1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ckap2Q3V1H1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ckap2Q3V1H1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ckap2Q3V1H1 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ckap2Q3V1H1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ckap2Q3V1H1 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Ckap2Q3V1H1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ckap2Q3V1H1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ckap2Q3V1H1 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ckap2Q3V1H1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ckap2Q3V1H1 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ckap2Q3V1H1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Ckap2Q3V1H1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ckap2Q3V1H1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ckap2Q3V1H1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ckap2Q3V1H1 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ckap2Q3V1H1 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ckap2Q3V1H1 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Ckap2Q3V1H1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Ckap2Q3V1H1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ckap2Q3V1H1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ckap2Q3V1H1 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ckap2Q3V1H1 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ckap2Q3V1H1 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ckap2Q3V1H1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ckap2Q3V1H1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ckap2Q3V1H1 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ckap2Q3V1H1 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ckap2Q3V1H1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ckap2Q3V1H1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ckap2Q3V1H1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ckap2Q3V1H1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ckap2Q3V1H1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ckap2Q3V1H1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ckap2Q3V1H1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ckap2Q3V1H1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ckap2Q3V1H1 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ckap2Q3V1H1 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ckap2Q3V1H1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ckap2Q3V1H1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ckap2Q3V1H1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ckap2Q3V1H1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ckap2Q3V1H1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ckap2Q3V1H1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ckap2Q3V1H1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ckap2Q3V1H1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ckap2Q3V1H1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ckap2Q3V1H1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ckap2Q3V1H1 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ckap2Q3V1H1 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ckap2Q3V1H1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ckap2Q3V1H1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ckap2Q3V1H1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ckap2Q3V1H1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ckap2Q3V1H1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ckap2Q3V1H1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ckap2Q3V1H1 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ckap2Q3V1H1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ckap2Q3V1H1 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ckap2Q3V1H1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ckap2Q3V1H1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ckap2Q3V1H1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ckap2Q3V1H1 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ckap2Q3V1H1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ckap2Q3V1H1 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ckap2Q3V1H1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ckap2Q3V1H1 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ckap2Q3V1H1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ckap2Q3V1H1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ckap2Q3V1H1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ckap2Q3V1H1 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ckap2Q3V1H1 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ckap2Q3V1H1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ckap2Q3V1H1 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ckap2Q3V1H1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ckap2Q3V1H1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ckap2Q3V1H1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ckap2Q3V1H1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ckap2Q3V1H1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ckap2Q3V1H1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ckap2Q3V1H1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ckap2Q3V1H1 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ckap2Q3V1H1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms