Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1D3

Ampd1, AMP deaminase 1, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ampd1Q3V1D3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ampd1Q3V1D3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ampd1Q3V1D3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ampd1Q3V1D3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ampd1Q3V1D3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ampd1Q3V1D3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ampd1Q3V1D3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ampd1Q3V1D3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ampd1Q3V1D3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ampd1Q3V1D3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ampd1Q3V1D3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ampd1Q3V1D3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ampd1Q3V1D3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ampd1Q3V1D3 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ampd1Q3V1D3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ampd1Q3V1D3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ampd1Q3V1D3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ampd1Q3V1D3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ampd1Q3V1D3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ampd1Q3V1D3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ampd1Q3V1D3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ampd1Q3V1D3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ampd1Q3V1D3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ampd1Q3V1D3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ampd1Q3V1D3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ampd1Q3V1D3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ampd1Q3V1D3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ampd1Q3V1D3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ampd1Q3V1D3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ampd1Q3V1D3 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ampd1Q3V1D3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ampd1Q3V1D3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ampd1Q3V1D3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ampd1Q3V1D3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ampd1Q3V1D3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ampd1Q3V1D3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ampd1Q3V1D3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ampd1Q3V1D3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ampd1Q3V1D3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ampd1Q3V1D3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ampd1Q3V1D3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ampd1Q3V1D3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ampd1Q3V1D3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ampd1Q3V1D3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ampd1Q3V1D3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ampd1Q3V1D3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ampd1Q3V1D3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ampd1Q3V1D3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ampd1Q3V1D3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ampd1Q3V1D3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ampd1Q3V1D3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ampd1Q3V1D3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ampd1Q3V1D3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ampd1Q3V1D3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ampd1Q3V1D3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ampd1Q3V1D3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ampd1Q3V1D3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ampd1Q3V1D3 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ampd1Q3V1D3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ampd1Q3V1D3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ampd1Q3V1D3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ampd1Q3V1D3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ampd1Q3V1D3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ampd1Q3V1D3 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ampd1Q3V1D3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ampd1Q3V1D3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ampd1Q3V1D3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ampd1Q3V1D3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ampd1Q3V1D3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ampd1Q3V1D3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ampd1Q3V1D3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ampd1Q3V1D3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ampd1Q3V1D3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ampd1Q3V1D3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ampd1Q3V1D3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ampd1Q3V1D3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ampd1Q3V1D3 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ampd1Q3V1D3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ampd1Q3V1D3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ampd1Q3V1D3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ampd1Q3V1D3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ampd1Q3V1D3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ampd1Q3V1D3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ampd1Q3V1D3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ampd1Q3V1D3 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ampd1Q3V1D3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ampd1Q3V1D3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ampd1Q3V1D3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ampd1Q3V1D3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ampd1Q3V1D3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ampd1Q3V1D3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ampd1Q3V1D3 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ampd1Q3V1D3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ampd1Q3V1D3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ampd1Q3V1D3 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ampd1Q3V1D3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ampd1Q3V1D3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ampd1Q3V1D3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ampd1Q3V1D3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ampd1Q3V1D3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms