Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lrrc43Q3V0L5 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Lrrc43Q3V0L5 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lrrc43Q3V0L5 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lrrc43Q3V0L5 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lrrc43Q3V0L5 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lrrc43Q3V0L5 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lrrc43Q3V0L5 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lrrc43Q3V0L5 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lrrc43Q3V0L5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lrrc43Q3V0L5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lrrc43Q3V0L5 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lrrc43Q3V0L5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lrrc43Q3V0L5 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lrrc43Q3V0L5 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lrrc43Q3V0L5 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lrrc43Q3V0L5 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lrrc43Q3V0L5 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lrrc43Q3V0L5 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Lrrc43Q3V0L5 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Lrrc43Q3V0L5 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lrrc43Q3V0L5 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lrrc43Q3V0L5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lrrc43Q3V0L5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lrrc43Q3V0L5 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lrrc43Q3V0L5 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Lrrc43Q3V0L5 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Lrrc43Q3V0L5 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Lrrc43Q3V0L5 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Lrrc43Q3V0L5 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Lrrc43Q3V0L5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Lrrc43Q3V0L5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Lrrc43Q3V0L5 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Lrrc43Q3V0L5 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Lrrc43Q3V0L5 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Lrrc43Q3V0L5 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lrrc43Q3V0L5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lrrc43Q3V0L5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lrrc43Q3V0L5 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lrrc43Q3V0L5 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lrrc43Q3V0L5 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lrrc43Q3V0L5 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lrrc43Q3V0L5 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lrrc43Q3V0L5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lrrc43Q3V0L5 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lrrc43Q3V0L5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lrrc43Q3V0L5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lrrc43Q3V0L5 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lrrc43Q3V0L5 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lrrc43Q3V0L5 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lrrc43Q3V0L5 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lrrc43Q3V0L5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lrrc43Q3V0L5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lrrc43Q3V0L5 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lrrc43Q3V0L5 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lrrc43Q3V0L5 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lrrc43Q3V0L5 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lrrc43Q3V0L5 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lrrc43Q3V0L5 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lrrc43Q3V0L5 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lrrc43Q3V0L5 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lrrc43Q3V0L5 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lrrc43Q3V0L5 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lrrc43Q3V0L5 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lrrc43Q3V0L5 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lrrc43Q3V0L5 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lrrc43Q3V0L5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lrrc43Q3V0L5 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lrrc43Q3V0L5 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lrrc43Q3V0L5 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lrrc43Q3V0L5 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lrrc43Q3V0L5 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lrrc43Q3V0L5 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lrrc43Q3V0L5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lrrc43Q3V0L5 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lrrc43Q3V0L5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Lrrc43Q3V0L5 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Lrrc43Q3V0L5 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Lrrc43Q3V0L5 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Lrrc43Q3V0L5 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Lrrc43Q3V0L5 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Lrrc43Q3V0L5 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Lrrc43Q3V0L5 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Lrrc43Q3V0L5 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lrrc43Q3V0L5 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lrrc43Q3V0L5 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lrrc43Q3V0L5 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lrrc43Q3V0L5 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lrrc43Q3V0L5 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lrrc43Q3V0L5 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lrrc43Q3V0L5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lrrc43Q3V0L5 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lrrc43Q3V0L5 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lrrc43Q3V0L5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lrrc43Q3V0L5 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lrrc43Q3V0L5 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Lrrc43Q3V0L5 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lrrc43Q3V0L5 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lrrc43Q3V0L5 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lrrc43Q3V0L5 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
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