Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0G7

Garnl3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Garnl3Q3V0G7 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Garnl3Q3V0G7 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Garnl3Q3V0G7 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Garnl3Q3V0G7 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Garnl3Q3V0G7 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Garnl3Q3V0G7 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Garnl3Q3V0G7 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Garnl3Q3V0G7 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Garnl3Q3V0G7 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Garnl3Q3V0G7 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Garnl3Q3V0G7 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Garnl3Q3V0G7 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Garnl3Q3V0G7 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Garnl3Q3V0G7 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Garnl3Q3V0G7 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Garnl3Q3V0G7 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Garnl3Q3V0G7 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Garnl3Q3V0G7 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Garnl3Q3V0G7 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Garnl3Q3V0G7 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Garnl3Q3V0G7 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Garnl3Q3V0G7 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Garnl3Q3V0G7 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Garnl3Q3V0G7 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Garnl3Q3V0G7 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Garnl3Q3V0G7 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Garnl3Q3V0G7 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Garnl3Q3V0G7 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Garnl3Q3V0G7 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Garnl3Q3V0G7 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Garnl3Q3V0G7 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Garnl3Q3V0G7 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Garnl3Q3V0G7 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Garnl3Q3V0G7 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Garnl3Q3V0G7 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Garnl3Q3V0G7 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Garnl3Q3V0G7 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Garnl3Q3V0G7 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Garnl3Q3V0G7 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Garnl3Q3V0G7 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Garnl3Q3V0G7 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Garnl3Q3V0G7 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Garnl3Q3V0G7 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Garnl3Q3V0G7 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Garnl3Q3V0G7 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Garnl3Q3V0G7 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Garnl3Q3V0G7 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Garnl3Q3V0G7 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Garnl3Q3V0G7 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Garnl3Q3V0G7 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Garnl3Q3V0G7 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Garnl3Q3V0G7 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Garnl3Q3V0G7 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Garnl3Q3V0G7 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Garnl3Q3V0G7 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Garnl3Q3V0G7 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Garnl3Q3V0G7 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Garnl3Q3V0G7 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Garnl3Q3V0G7 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Garnl3Q3V0G7 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Garnl3Q3V0G7 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Garnl3Q3V0G7 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Garnl3Q3V0G7 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Garnl3Q3V0G7 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Garnl3Q3V0G7 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Garnl3Q3V0G7 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Garnl3Q3V0G7 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Garnl3Q3V0G7 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Garnl3Q3V0G7 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Garnl3Q3V0G7 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Garnl3Q3V0G7 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Garnl3Q3V0G7 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Garnl3Q3V0G7 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Garnl3Q3V0G7 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Garnl3Q3V0G7 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Garnl3Q3V0G7 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Garnl3Q3V0G7 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Garnl3Q3V0G7 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Garnl3Q3V0G7 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Garnl3Q3V0G7 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Garnl3Q3V0G7 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Garnl3Q3V0G7 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Garnl3Q3V0G7 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Garnl3Q3V0G7 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Garnl3Q3V0G7 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Garnl3Q3V0G7 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Garnl3Q3V0G7 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Garnl3Q3V0G7 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Garnl3Q3V0G7 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Garnl3Q3V0G7 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Garnl3Q3V0G7 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Garnl3Q3V0G7 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Garnl3Q3V0G7 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Garnl3Q3V0G7 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Garnl3Q3V0G7 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Garnl3Q3V0G7 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Garnl3Q3V0G7 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Garnl3Q3V0G7 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Garnl3Q3V0G7 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Garnl3Q3V0G7 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms