Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0B4

Cfap65, Cilia- and flagella-associated protein 65, mousemouse

Predictions only

Length 1,847 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap65Q3V0B4 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
Cfap65Q3V0B4 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Cfap65Q3V0B4 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Cfap65Q3V0B4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Cfap65Q3V0B4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Cfap65Q3V0B4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Cfap65Q3V0B4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Cfap65Q3V0B4 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Cfap65Q3V0B4 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Cfap65Q3V0B4 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Cfap65Q3V0B4 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Cfap65Q3V0B4 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Cfap65Q3V0B4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Cfap65Q3V0B4 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Cfap65Q3V0B4 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Cfap65Q3V0B4 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cfap65Q3V0B4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cfap65Q3V0B4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cfap65Q3V0B4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Cfap65Q3V0B4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Cfap65Q3V0B4 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Cfap65Q3V0B4 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Cfap65Q3V0B4 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Cfap65Q3V0B4 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Cfap65Q3V0B4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Cfap65Q3V0B4 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Cfap65Q3V0B4 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Cfap65Q3V0B4 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Cfap65Q3V0B4 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Cfap65Q3V0B4 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Cfap65Q3V0B4 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Cfap65Q3V0B4 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Cfap65Q3V0B4 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Cfap65Q3V0B4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Cfap65Q3V0B4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Cfap65Q3V0B4 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Cfap65Q3V0B4 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Cfap65Q3V0B4 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Cfap65Q3V0B4 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Cfap65Q3V0B4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Cfap65Q3V0B4 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Cfap65Q3V0B4 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Cfap65Q3V0B4 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Cfap65Q3V0B4 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Cfap65Q3V0B4 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Cfap65Q3V0B4 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Cfap65Q3V0B4 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Cfap65Q3V0B4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Cfap65Q3V0B4 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Cfap65Q3V0B4 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Cfap65Q3V0B4 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Cfap65Q3V0B4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Cfap65Q3V0B4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Cfap65Q3V0B4 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Cfap65Q3V0B4 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Cfap65Q3V0B4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Cfap65Q3V0B4 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Cfap65Q3V0B4 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Cfap65Q3V0B4 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Cfap65Q3V0B4 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Cfap65Q3V0B4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Cfap65Q3V0B4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Cfap65Q3V0B4 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cfap65Q3V0B4 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cfap65Q3V0B4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cfap65Q3V0B4 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cfap65Q3V0B4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cfap65Q3V0B4 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cfap65Q3V0B4 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cfap65Q3V0B4 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cfap65Q3V0B4 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cfap65Q3V0B4 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cfap65Q3V0B4 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cfap65Q3V0B4 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cfap65Q3V0B4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cfap65Q3V0B4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cfap65Q3V0B4 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cfap65Q3V0B4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Cfap65Q3V0B4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Cfap65Q3V0B4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Cfap65Q3V0B4 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Cfap65Q3V0B4 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Cfap65Q3V0B4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Cfap65Q3V0B4 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Cfap65Q3V0B4 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Cfap65Q3V0B4 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Cfap65Q3V0B4 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Cfap65Q3V0B4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Cfap65Q3V0B4 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Cfap65Q3V0B4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Cfap65Q3V0B4 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Cfap65Q3V0B4 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Cfap65Q3V0B4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Cfap65Q3V0B4 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Cfap65Q3V0B4 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Cfap65Q3V0B4 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Cfap65Q3V0B4 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Cfap65Q3V0B4 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Cfap65Q3V0B4 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Cfap65Q3V0B4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms