Protein–RNA interactions for Protein: Q3V038

Ttc9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9Q3V038 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ttc9Q3V038 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ttc9Q3V038 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ttc9Q3V038 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ttc9Q3V038 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ttc9Q3V038 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ttc9Q3V038 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ttc9Q3V038 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ttc9Q3V038 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ttc9Q3V038 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ttc9Q3V038 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ttc9Q3V038 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ttc9Q3V038 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Ttc9Q3V038 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ttc9Q3V038 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ttc9Q3V038 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ttc9Q3V038 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ttc9Q3V038 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ttc9Q3V038 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ttc9Q3V038 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ttc9Q3V038 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ttc9Q3V038 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttc9Q3V038 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttc9Q3V038 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttc9Q3V038 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttc9Q3V038 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttc9Q3V038 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttc9Q3V038 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttc9Q3V038 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttc9Q3V038 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttc9Q3V038 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttc9Q3V038 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttc9Q3V038 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ttc9Q3V038 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ttc9Q3V038 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ttc9Q3V038 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ttc9Q3V038 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ttc9Q3V038 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ttc9Q3V038 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ttc9Q3V038 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ttc9Q3V038 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ttc9Q3V038 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ttc9Q3V038 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ttc9Q3V038 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ttc9Q3V038 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ttc9Q3V038 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ttc9Q3V038 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ttc9Q3V038 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttc9Q3V038 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttc9Q3V038 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttc9Q3V038 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttc9Q3V038 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttc9Q3V038 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttc9Q3V038 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttc9Q3V038 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttc9Q3V038 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttc9Q3V038 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttc9Q3V038 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttc9Q3V038 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttc9Q3V038 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttc9Q3V038 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttc9Q3V038 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttc9Q3V038 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttc9Q3V038 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ttc9Q3V038 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ttc9Q3V038 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ttc9Q3V038 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ttc9Q3V038 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ttc9Q3V038 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ttc9Q3V038 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ttc9Q3V038 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ttc9Q3V038 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ttc9Q3V038 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ttc9Q3V038 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ttc9Q3V038 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ttc9Q3V038 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ttc9Q3V038 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttc9Q3V038 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttc9Q3V038 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttc9Q3V038 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttc9Q3V038 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttc9Q3V038 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttc9Q3V038 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttc9Q3V038 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttc9Q3V038 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttc9Q3V038 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttc9Q3V038 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttc9Q3V038 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttc9Q3V038 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttc9Q3V038 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttc9Q3V038 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttc9Q3V038 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttc9Q3V038 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttc9Q3V038 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttc9Q3V038 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttc9Q3V038 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttc9Q3V038 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttc9Q3V038 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttc9Q3V038 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttc9Q3V038 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.4 ms