Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ39

Lrrfip1, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrfip1Q3UZ39 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lrrfip1Q3UZ39 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lrrfip1Q3UZ39 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Lrrfip1Q3UZ39 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Lrrfip1Q3UZ39 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrrfip1Q3UZ39 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrrfip1Q3UZ39 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrrfip1Q3UZ39 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrrfip1Q3UZ39 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrrfip1Q3UZ39 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrrfip1Q3UZ39 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrrfip1Q3UZ39 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrrfip1Q3UZ39 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrrfip1Q3UZ39 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrrfip1Q3UZ39 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrrfip1Q3UZ39 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrrfip1Q3UZ39 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrrfip1Q3UZ39 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrrfip1Q3UZ39 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrrfip1Q3UZ39 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrrfip1Q3UZ39 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrrfip1Q3UZ39 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrrfip1Q3UZ39 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrrfip1Q3UZ39 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrrfip1Q3UZ39 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrrfip1Q3UZ39 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrrfip1Q3UZ39 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrrfip1Q3UZ39 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrrfip1Q3UZ39 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrrfip1Q3UZ39 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrrfip1Q3UZ39 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrrfip1Q3UZ39 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrrfip1Q3UZ39 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrrfip1Q3UZ39 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrrfip1Q3UZ39 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrrfip1Q3UZ39 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrrfip1Q3UZ39 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrrfip1Q3UZ39 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrrfip1Q3UZ39 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrrfip1Q3UZ39 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrrfip1Q3UZ39 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrrfip1Q3UZ39 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrrfip1Q3UZ39 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrrfip1Q3UZ39 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrrfip1Q3UZ39 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrrfip1Q3UZ39 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrrfip1Q3UZ39 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrrfip1Q3UZ39 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrrfip1Q3UZ39 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrrfip1Q3UZ39 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrrfip1Q3UZ39 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrrfip1Q3UZ39 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrrfip1Q3UZ39 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrrfip1Q3UZ39 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrrfip1Q3UZ39 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrrfip1Q3UZ39 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrrfip1Q3UZ39 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrrfip1Q3UZ39 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrrfip1Q3UZ39 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrrfip1Q3UZ39 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrrfip1Q3UZ39 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrrfip1Q3UZ39 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrrfip1Q3UZ39 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrrfip1Q3UZ39 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrrfip1Q3UZ39 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrrfip1Q3UZ39 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrrfip1Q3UZ39 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrrfip1Q3UZ39 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrrfip1Q3UZ39 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrrfip1Q3UZ39 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrrfip1Q3UZ39 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrrfip1Q3UZ39 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrrfip1Q3UZ39 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrrfip1Q3UZ39 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrrfip1Q3UZ39 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrrfip1Q3UZ39 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrrfip1Q3UZ39 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrrfip1Q3UZ39 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrrfip1Q3UZ39 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrrfip1Q3UZ39 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrrfip1Q3UZ39 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrrfip1Q3UZ39 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrrfip1Q3UZ39 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrrfip1Q3UZ39 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrrfip1Q3UZ39 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrrfip1Q3UZ39 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrrfip1Q3UZ39 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrrfip1Q3UZ39 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrrfip1Q3UZ39 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrrfip1Q3UZ39 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrrfip1Q3UZ39 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrrfip1Q3UZ39 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrrfip1Q3UZ39 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrrfip1Q3UZ39 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrrfip1Q3UZ39 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrrfip1Q3UZ39 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrrfip1Q3UZ39 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrrfip1Q3UZ39 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrrfip1Q3UZ39 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrrfip1Q3UZ39 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms