Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUY6

Prom2, Prominin-2, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prom2Q3UUY6 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Prom2Q3UUY6 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Prom2Q3UUY6 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Prom2Q3UUY6 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Prom2Q3UUY6 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Prom2Q3UUY6 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Prom2Q3UUY6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Prom2Q3UUY6 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Prom2Q3UUY6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Prom2Q3UUY6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Prom2Q3UUY6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Prom2Q3UUY6 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Prom2Q3UUY6 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Prom2Q3UUY6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Prom2Q3UUY6 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Prom2Q3UUY6 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Prom2Q3UUY6 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Prom2Q3UUY6 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Prom2Q3UUY6 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Prom2Q3UUY6 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Prom2Q3UUY6 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Prom2Q3UUY6 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Prom2Q3UUY6 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Prom2Q3UUY6 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Prom2Q3UUY6 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Prom2Q3UUY6 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Prom2Q3UUY6 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Prom2Q3UUY6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Prom2Q3UUY6 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Prom2Q3UUY6 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Prom2Q3UUY6 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Prom2Q3UUY6 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Prom2Q3UUY6 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Prom2Q3UUY6 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Prom2Q3UUY6 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Prom2Q3UUY6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Prom2Q3UUY6 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Prom2Q3UUY6 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Prom2Q3UUY6 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Prom2Q3UUY6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Prom2Q3UUY6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Prom2Q3UUY6 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Prom2Q3UUY6 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Prom2Q3UUY6 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Prom2Q3UUY6 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Prom2Q3UUY6 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Prom2Q3UUY6 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Prom2Q3UUY6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Prom2Q3UUY6 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Prom2Q3UUY6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Prom2Q3UUY6 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Prom2Q3UUY6 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Prom2Q3UUY6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Prom2Q3UUY6 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Prom2Q3UUY6 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Prom2Q3UUY6 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Prom2Q3UUY6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Prom2Q3UUY6 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Prom2Q3UUY6 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Prom2Q3UUY6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Prom2Q3UUY6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Prom2Q3UUY6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Prom2Q3UUY6 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Prom2Q3UUY6 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Prom2Q3UUY6 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Prom2Q3UUY6 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Prom2Q3UUY6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Prom2Q3UUY6 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Prom2Q3UUY6 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Prom2Q3UUY6 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Prom2Q3UUY6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Prom2Q3UUY6 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Prom2Q3UUY6 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Prom2Q3UUY6 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Prom2Q3UUY6 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Prom2Q3UUY6 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Prom2Q3UUY6 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Prom2Q3UUY6 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Prom2Q3UUY6 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Prom2Q3UUY6 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Prom2Q3UUY6 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Prom2Q3UUY6 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Prom2Q3UUY6 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Prom2Q3UUY6 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Prom2Q3UUY6 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Prom2Q3UUY6 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Prom2Q3UUY6 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Prom2Q3UUY6 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Prom2Q3UUY6 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Prom2Q3UUY6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Prom2Q3UUY6 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Prom2Q3UUY6 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Prom2Q3UUY6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Prom2Q3UUY6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Prom2Q3UUY6 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Prom2Q3UUY6 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Prom2Q3UUY6 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Prom2Q3UUY6 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Prom2Q3UUY6 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Prom2Q3UUY6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms