Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT54

Obox3, Oocyte-specific homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Obox3Q3UT54 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Obox3Q3UT54 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Obox3Q3UT54 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Obox3Q3UT54 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Obox3Q3UT54 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Obox3Q3UT54 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Obox3Q3UT54 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Obox3Q3UT54 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Obox3Q3UT54 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Obox3Q3UT54 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Obox3Q3UT54 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Obox3Q3UT54 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Obox3Q3UT54 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Obox3Q3UT54 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Obox3Q3UT54 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Obox3Q3UT54 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Obox3Q3UT54 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Obox3Q3UT54 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Obox3Q3UT54 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Obox3Q3UT54 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Obox3Q3UT54 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Obox3Q3UT54 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Obox3Q3UT54 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Obox3Q3UT54 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Obox3Q3UT54 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Obox3Q3UT54 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Obox3Q3UT54 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Obox3Q3UT54 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Obox3Q3UT54 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Obox3Q3UT54 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Obox3Q3UT54 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Obox3Q3UT54 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Obox3Q3UT54 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Obox3Q3UT54 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Obox3Q3UT54 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Obox3Q3UT54 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Obox3Q3UT54 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Obox3Q3UT54 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Obox3Q3UT54 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Obox3Q3UT54 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Obox3Q3UT54 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Obox3Q3UT54 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Obox3Q3UT54 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Obox3Q3UT54 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Obox3Q3UT54 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Obox3Q3UT54 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Obox3Q3UT54 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Obox3Q3UT54 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Obox3Q3UT54 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Obox3Q3UT54 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Obox3Q3UT54 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Obox3Q3UT54 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Obox3Q3UT54 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Obox3Q3UT54 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Obox3Q3UT54 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Obox3Q3UT54 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Obox3Q3UT54 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Obox3Q3UT54 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Obox3Q3UT54 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Obox3Q3UT54 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Obox3Q3UT54 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Obox3Q3UT54 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Obox3Q3UT54 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Obox3Q3UT54 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Obox3Q3UT54 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Obox3Q3UT54 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Obox3Q3UT54 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Obox3Q3UT54 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Obox3Q3UT54 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Obox3Q3UT54 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Obox3Q3UT54 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Obox3Q3UT54 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Obox3Q3UT54 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Obox3Q3UT54 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Obox3Q3UT54 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Obox3Q3UT54 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Obox3Q3UT54 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Obox3Q3UT54 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Obox3Q3UT54 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Obox3Q3UT54 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Obox3Q3UT54 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Obox3Q3UT54 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Obox3Q3UT54 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Obox3Q3UT54 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Obox3Q3UT54 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Obox3Q3UT54 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Obox3Q3UT54 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Obox3Q3UT54 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Obox3Q3UT54 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Obox3Q3UT54 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Obox3Q3UT54 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Obox3Q3UT54 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Obox3Q3UT54 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Obox3Q3UT54 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Obox3Q3UT54 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Obox3Q3UT54 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Obox3Q3UT54 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Obox3Q3UT54 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Obox3Q3UT54 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Obox3Q3UT54 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms