Protein–RNA interactions for Protein: Q3USW4

B230104I21Rik, RIKEN cDNA B230104I21 gene, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B230104I21RikQ3USW4 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
B230104I21RikQ3USW4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
B230104I21RikQ3USW4 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
B230104I21RikQ3USW4 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
B230104I21RikQ3USW4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
B230104I21RikQ3USW4 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
B230104I21RikQ3USW4 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
B230104I21RikQ3USW4 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
B230104I21RikQ3USW4 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
B230104I21RikQ3USW4 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
B230104I21RikQ3USW4 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
B230104I21RikQ3USW4 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
B230104I21RikQ3USW4 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
B230104I21RikQ3USW4 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
B230104I21RikQ3USW4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
B230104I21RikQ3USW4 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
B230104I21RikQ3USW4 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
B230104I21RikQ3USW4 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
B230104I21RikQ3USW4 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
B230104I21RikQ3USW4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
B230104I21RikQ3USW4 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
B230104I21RikQ3USW4 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
B230104I21RikQ3USW4 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
B230104I21RikQ3USW4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
B230104I21RikQ3USW4 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
B230104I21RikQ3USW4 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
B230104I21RikQ3USW4 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
B230104I21RikQ3USW4 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
B230104I21RikQ3USW4 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
B230104I21RikQ3USW4 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
B230104I21RikQ3USW4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
B230104I21RikQ3USW4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
B230104I21RikQ3USW4 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
B230104I21RikQ3USW4 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
B230104I21RikQ3USW4 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
B230104I21RikQ3USW4 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
B230104I21RikQ3USW4 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
B230104I21RikQ3USW4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
B230104I21RikQ3USW4 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
B230104I21RikQ3USW4 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
B230104I21RikQ3USW4 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
B230104I21RikQ3USW4 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
B230104I21RikQ3USW4 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
B230104I21RikQ3USW4 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
B230104I21RikQ3USW4 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
B230104I21RikQ3USW4 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
B230104I21RikQ3USW4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
B230104I21RikQ3USW4 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
B230104I21RikQ3USW4 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
B230104I21RikQ3USW4 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
B230104I21RikQ3USW4 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
B230104I21RikQ3USW4 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
B230104I21RikQ3USW4 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
B230104I21RikQ3USW4 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
B230104I21RikQ3USW4 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
B230104I21RikQ3USW4 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
B230104I21RikQ3USW4 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
B230104I21RikQ3USW4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
B230104I21RikQ3USW4 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
B230104I21RikQ3USW4 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
B230104I21RikQ3USW4 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
B230104I21RikQ3USW4 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
B230104I21RikQ3USW4 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
B230104I21RikQ3USW4 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
B230104I21RikQ3USW4 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
B230104I21RikQ3USW4 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
B230104I21RikQ3USW4 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
B230104I21RikQ3USW4 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
B230104I21RikQ3USW4 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
B230104I21RikQ3USW4 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
B230104I21RikQ3USW4 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
B230104I21RikQ3USW4 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
B230104I21RikQ3USW4 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
B230104I21RikQ3USW4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
B230104I21RikQ3USW4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
B230104I21RikQ3USW4 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
B230104I21RikQ3USW4 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
B230104I21RikQ3USW4 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
B230104I21RikQ3USW4 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
B230104I21RikQ3USW4 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
B230104I21RikQ3USW4 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
B230104I21RikQ3USW4 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
B230104I21RikQ3USW4 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
B230104I21RikQ3USW4 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
B230104I21RikQ3USW4 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
B230104I21RikQ3USW4 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
B230104I21RikQ3USW4 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
B230104I21RikQ3USW4 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
B230104I21RikQ3USW4 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
B230104I21RikQ3USW4 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
B230104I21RikQ3USW4 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
B230104I21RikQ3USW4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
B230104I21RikQ3USW4 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
B230104I21RikQ3USW4 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
B230104I21RikQ3USW4 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
B230104I21RikQ3USW4 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
B230104I21RikQ3USW4 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
B230104I21RikQ3USW4 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
B230104I21RikQ3USW4 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
B230104I21RikQ3USW4 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms