Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znf48Q3US17 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znf48Q3US17 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Znf48Q3US17 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znf48Q3US17 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znf48Q3US17 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znf48Q3US17 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Znf48Q3US17 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znf48Q3US17 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znf48Q3US17 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znf48Q3US17 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znf48Q3US17 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znf48Q3US17 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znf48Q3US17 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znf48Q3US17 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Znf48Q3US17 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znf48Q3US17 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znf48Q3US17 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf48Q3US17 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf48Q3US17 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf48Q3US17 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf48Q3US17 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf48Q3US17 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf48Q3US17 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf48Q3US17 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf48Q3US17 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf48Q3US17 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf48Q3US17 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf48Q3US17 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf48Q3US17 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf48Q3US17 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf48Q3US17 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf48Q3US17 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf48Q3US17 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf48Q3US17 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Znf48Q3US17 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Znf48Q3US17 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf48Q3US17 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf48Q3US17 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf48Q3US17 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf48Q3US17 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf48Q3US17 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf48Q3US17 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf48Q3US17 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf48Q3US17 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf48Q3US17 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf48Q3US17 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf48Q3US17 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf48Q3US17 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf48Q3US17 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf48Q3US17 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf48Q3US17 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf48Q3US17 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf48Q3US17 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf48Q3US17 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf48Q3US17 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf48Q3US17 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf48Q3US17 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf48Q3US17 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf48Q3US17 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf48Q3US17 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf48Q3US17 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf48Q3US17 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf48Q3US17 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf48Q3US17 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf48Q3US17 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf48Q3US17 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf48Q3US17 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf48Q3US17 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf48Q3US17 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf48Q3US17 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf48Q3US17 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf48Q3US17 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf48Q3US17 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf48Q3US17 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf48Q3US17 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf48Q3US17 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf48Q3US17 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf48Q3US17 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf48Q3US17 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf48Q3US17 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf48Q3US17 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf48Q3US17 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf48Q3US17 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf48Q3US17 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf48Q3US17 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf48Q3US17 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf48Q3US17 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf48Q3US17 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf48Q3US17 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf48Q3US17 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf48Q3US17 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf48Q3US17 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf48Q3US17 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf48Q3US17 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf48Q3US17 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf48Q3US17 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf48Q3US17 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf48Q3US17 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf48Q3US17 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms