Protein–RNA interactions for Protein: Q3URE1

Acsf3, Acyl-CoA synthetase family member 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acsf3Q3URE1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Acsf3Q3URE1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Acsf3Q3URE1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Acsf3Q3URE1 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Acsf3Q3URE1 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Acsf3Q3URE1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Acsf3Q3URE1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Acsf3Q3URE1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Acsf3Q3URE1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Acsf3Q3URE1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Acsf3Q3URE1 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Acsf3Q3URE1 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Acsf3Q3URE1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Acsf3Q3URE1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Acsf3Q3URE1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Acsf3Q3URE1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Acsf3Q3URE1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Acsf3Q3URE1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Acsf3Q3URE1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Acsf3Q3URE1 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Acsf3Q3URE1 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Acsf3Q3URE1 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Acsf3Q3URE1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Acsf3Q3URE1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Acsf3Q3URE1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Acsf3Q3URE1 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Acsf3Q3URE1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Acsf3Q3URE1 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Acsf3Q3URE1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Acsf3Q3URE1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Acsf3Q3URE1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Acsf3Q3URE1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Acsf3Q3URE1 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Acsf3Q3URE1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Acsf3Q3URE1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Acsf3Q3URE1 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Acsf3Q3URE1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Acsf3Q3URE1 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Acsf3Q3URE1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Acsf3Q3URE1 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Acsf3Q3URE1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Acsf3Q3URE1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Acsf3Q3URE1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Acsf3Q3URE1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Acsf3Q3URE1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Acsf3Q3URE1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Acsf3Q3URE1 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Acsf3Q3URE1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Acsf3Q3URE1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Acsf3Q3URE1 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Acsf3Q3URE1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Acsf3Q3URE1 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Acsf3Q3URE1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Acsf3Q3URE1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Acsf3Q3URE1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Acsf3Q3URE1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Acsf3Q3URE1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Acsf3Q3URE1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Acsf3Q3URE1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Acsf3Q3URE1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Acsf3Q3URE1 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Acsf3Q3URE1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Acsf3Q3URE1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Acsf3Q3URE1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Acsf3Q3URE1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Acsf3Q3URE1 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Acsf3Q3URE1 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Acsf3Q3URE1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Acsf3Q3URE1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Acsf3Q3URE1 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Acsf3Q3URE1 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Acsf3Q3URE1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Acsf3Q3URE1 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Acsf3Q3URE1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Acsf3Q3URE1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Acsf3Q3URE1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Acsf3Q3URE1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Acsf3Q3URE1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Acsf3Q3URE1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Acsf3Q3URE1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Acsf3Q3URE1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Acsf3Q3URE1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Acsf3Q3URE1 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Acsf3Q3URE1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Acsf3Q3URE1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Acsf3Q3URE1 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Acsf3Q3URE1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Acsf3Q3URE1 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Acsf3Q3URE1 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Acsf3Q3URE1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Acsf3Q3URE1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Acsf3Q3URE1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Acsf3Q3URE1 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Acsf3Q3URE1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Acsf3Q3URE1 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Acsf3Q3URE1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Acsf3Q3URE1 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Acsf3Q3URE1 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Acsf3Q3URE1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Acsf3Q3URE1 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.7 ms