Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
E130208F15RikQ3UPV3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
E130208F15RikQ3UPV3 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
E130208F15RikQ3UPV3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
E130208F15RikQ3UPV3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
E130208F15RikQ3UPV3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
E130208F15RikQ3UPV3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
E130208F15RikQ3UPV3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
E130208F15RikQ3UPV3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
E130208F15RikQ3UPV3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
E130208F15RikQ3UPV3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
E130208F15RikQ3UPV3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
E130208F15RikQ3UPV3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
E130208F15RikQ3UPV3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
E130208F15RikQ3UPV3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
E130208F15RikQ3UPV3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
E130208F15RikQ3UPV3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
E130208F15RikQ3UPV3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
E130208F15RikQ3UPV3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
E130208F15RikQ3UPV3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
E130208F15RikQ3UPV3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
E130208F15RikQ3UPV3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
E130208F15RikQ3UPV3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
E130208F15RikQ3UPV3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
E130208F15RikQ3UPV3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
E130208F15RikQ3UPV3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
E130208F15RikQ3UPV3 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
E130208F15RikQ3UPV3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
E130208F15RikQ3UPV3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
E130208F15RikQ3UPV3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
E130208F15RikQ3UPV3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
E130208F15RikQ3UPV3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
E130208F15RikQ3UPV3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
E130208F15RikQ3UPV3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
E130208F15RikQ3UPV3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
E130208F15RikQ3UPV3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
E130208F15RikQ3UPV3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
E130208F15RikQ3UPV3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
E130208F15RikQ3UPV3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
E130208F15RikQ3UPV3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
E130208F15RikQ3UPV3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
E130208F15RikQ3UPV3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
E130208F15RikQ3UPV3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
E130208F15RikQ3UPV3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
E130208F15RikQ3UPV3 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
E130208F15RikQ3UPV3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
E130208F15RikQ3UPV3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
E130208F15RikQ3UPV3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
E130208F15RikQ3UPV3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
E130208F15RikQ3UPV3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
E130208F15RikQ3UPV3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
E130208F15RikQ3UPV3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
E130208F15RikQ3UPV3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
E130208F15RikQ3UPV3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
E130208F15RikQ3UPV3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
E130208F15RikQ3UPV3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
E130208F15RikQ3UPV3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
E130208F15RikQ3UPV3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
E130208F15RikQ3UPV3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
E130208F15RikQ3UPV3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
E130208F15RikQ3UPV3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
E130208F15RikQ3UPV3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
E130208F15RikQ3UPV3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
E130208F15RikQ3UPV3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
E130208F15RikQ3UPV3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
E130208F15RikQ3UPV3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
E130208F15RikQ3UPV3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
E130208F15RikQ3UPV3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
E130208F15RikQ3UPV3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
E130208F15RikQ3UPV3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
E130208F15RikQ3UPV3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
E130208F15RikQ3UPV3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
E130208F15RikQ3UPV3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
E130208F15RikQ3UPV3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
E130208F15RikQ3UPV3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
E130208F15RikQ3UPV3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
E130208F15RikQ3UPV3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
E130208F15RikQ3UPV3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
E130208F15RikQ3UPV3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
E130208F15RikQ3UPV3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
E130208F15RikQ3UPV3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
E130208F15RikQ3UPV3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
E130208F15RikQ3UPV3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
E130208F15RikQ3UPV3 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
E130208F15RikQ3UPV3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
E130208F15RikQ3UPV3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
E130208F15RikQ3UPV3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
E130208F15RikQ3UPV3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
E130208F15RikQ3UPV3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
E130208F15RikQ3UPV3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
E130208F15RikQ3UPV3 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
E130208F15RikQ3UPV3 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
E130208F15RikQ3UPV3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms