Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPC7

Uncharacterized protein KIAA0825 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UPC7 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Q3UPC7 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Q3UPC7 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Q3UPC7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Q3UPC7 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Q3UPC7 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Q3UPC7 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Q3UPC7 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Q3UPC7 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Q3UPC7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Q3UPC7 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Q3UPC7 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Q3UPC7 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Q3UPC7 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Q3UPC7 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Q3UPC7 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Q3UPC7 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Q3UPC7 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Q3UPC7 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Q3UPC7 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Q3UPC7 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Q3UPC7 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Q3UPC7 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Q3UPC7 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Q3UPC7 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Q3UPC7 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Q3UPC7 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Q3UPC7 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Q3UPC7 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Q3UPC7 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Q3UPC7 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Q3UPC7 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Q3UPC7 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Q3UPC7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Q3UPC7 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Q3UPC7 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Q3UPC7 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Q3UPC7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Q3UPC7 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Q3UPC7 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Q3UPC7 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Q3UPC7 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Q3UPC7 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Q3UPC7 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Q3UPC7 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Q3UPC7 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Q3UPC7 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Q3UPC7 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Q3UPC7 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Q3UPC7 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Q3UPC7 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Q3UPC7 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Q3UPC7 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Q3UPC7 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Q3UPC7 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Q3UPC7 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Q3UPC7 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Q3UPC7 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Q3UPC7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Q3UPC7 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Q3UPC7 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Q3UPC7 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Q3UPC7 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Q3UPC7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Q3UPC7 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Q3UPC7 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Q3UPC7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Q3UPC7 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Q3UPC7 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Q3UPC7 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Q3UPC7 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Q3UPC7 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Q3UPC7 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Q3UPC7 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Q3UPC7 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Q3UPC7 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Q3UPC7 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Q3UPC7 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Q3UPC7 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Q3UPC7 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Q3UPC7 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Q3UPC7 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Q3UPC7 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Q3UPC7 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Q3UPC7 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Q3UPC7 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Q3UPC7 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Q3UPC7 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Q3UPC7 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Q3UPC7 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Q3UPC7 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Q3UPC7 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Q3UPC7 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Q3UPC7 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Q3UPC7 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Q3UPC7 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Q3UPC7 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Q3UPC7 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Q3UPC7 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Q3UPC7 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms