Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Skap2Q3UND0 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Skap2Q3UND0 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Skap2Q3UND0 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Skap2Q3UND0 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Skap2Q3UND0 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Skap2Q3UND0 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Skap2Q3UND0 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Skap2Q3UND0 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Skap2Q3UND0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Skap2Q3UND0 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Skap2Q3UND0 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Skap2Q3UND0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Skap2Q3UND0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Skap2Q3UND0 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Skap2Q3UND0 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Skap2Q3UND0 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Skap2Q3UND0 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Skap2Q3UND0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Skap2Q3UND0 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Skap2Q3UND0 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Skap2Q3UND0 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Skap2Q3UND0 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Skap2Q3UND0 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Skap2Q3UND0 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Skap2Q3UND0 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Skap2Q3UND0 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Skap2Q3UND0 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Skap2Q3UND0 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Skap2Q3UND0 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Skap2Q3UND0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Skap2Q3UND0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Skap2Q3UND0 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Skap2Q3UND0 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Skap2Q3UND0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Skap2Q3UND0 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Skap2Q3UND0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Skap2Q3UND0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Skap2Q3UND0 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Skap2Q3UND0 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Skap2Q3UND0 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Skap2Q3UND0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Skap2Q3UND0 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Skap2Q3UND0 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Skap2Q3UND0 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Skap2Q3UND0 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Skap2Q3UND0 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Skap2Q3UND0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Skap2Q3UND0 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Skap2Q3UND0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Skap2Q3UND0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Skap2Q3UND0 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Skap2Q3UND0 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Skap2Q3UND0 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Skap2Q3UND0 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Skap2Q3UND0 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Skap2Q3UND0 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Skap2Q3UND0 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Skap2Q3UND0 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Skap2Q3UND0 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Skap2Q3UND0 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Skap2Q3UND0 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Skap2Q3UND0 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Skap2Q3UND0 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Skap2Q3UND0 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Skap2Q3UND0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Skap2Q3UND0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Skap2Q3UND0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Skap2Q3UND0 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Skap2Q3UND0 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Skap2Q3UND0 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Skap2Q3UND0 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Skap2Q3UND0 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Skap2Q3UND0 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Skap2Q3UND0 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Skap2Q3UND0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Skap2Q3UND0 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Skap2Q3UND0 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Skap2Q3UND0 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Skap2Q3UND0 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Skap2Q3UND0 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Skap2Q3UND0 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Skap2Q3UND0 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Skap2Q3UND0 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Skap2Q3UND0 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Skap2Q3UND0 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Skap2Q3UND0 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Skap2Q3UND0 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Skap2Q3UND0 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Skap2Q3UND0 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Skap2Q3UND0 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Skap2Q3UND0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Skap2Q3UND0 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Skap2Q3UND0 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Skap2Q3UND0 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Skap2Q3UND0 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Skap2Q3UND0 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Skap2Q3UND0 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Skap2Q3UND0 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Skap2Q3UND0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms