Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMU9

Hdgfl2, Hepatoma-derived growth factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl2Q3UMU9 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hdgfl2Q3UMU9 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hdgfl2Q3UMU9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Hdgfl2Q3UMU9 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Hdgfl2Q3UMU9 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Hdgfl2Q3UMU9 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Hdgfl2Q3UMU9 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Hdgfl2Q3UMU9 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Hdgfl2Q3UMU9 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Hdgfl2Q3UMU9 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hdgfl2Q3UMU9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hdgfl2Q3UMU9 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hdgfl2Q3UMU9 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hdgfl2Q3UMU9 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hdgfl2Q3UMU9 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hdgfl2Q3UMU9 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hdgfl2Q3UMU9 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hdgfl2Q3UMU9 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hdgfl2Q3UMU9 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hdgfl2Q3UMU9 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hdgfl2Q3UMU9 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hdgfl2Q3UMU9 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hdgfl2Q3UMU9 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hdgfl2Q3UMU9 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hdgfl2Q3UMU9 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hdgfl2Q3UMU9 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hdgfl2Q3UMU9 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hdgfl2Q3UMU9 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hdgfl2Q3UMU9 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hdgfl2Q3UMU9 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hdgfl2Q3UMU9 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hdgfl2Q3UMU9 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hdgfl2Q3UMU9 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hdgfl2Q3UMU9 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hdgfl2Q3UMU9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hdgfl2Q3UMU9 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hdgfl2Q3UMU9 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hdgfl2Q3UMU9 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hdgfl2Q3UMU9 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hdgfl2Q3UMU9 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hdgfl2Q3UMU9 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hdgfl2Q3UMU9 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hdgfl2Q3UMU9 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hdgfl2Q3UMU9 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hdgfl2Q3UMU9 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hdgfl2Q3UMU9 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hdgfl2Q3UMU9 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hdgfl2Q3UMU9 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hdgfl2Q3UMU9 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hdgfl2Q3UMU9 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Hdgfl2Q3UMU9 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hdgfl2Q3UMU9 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hdgfl2Q3UMU9 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hdgfl2Q3UMU9 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hdgfl2Q3UMU9 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hdgfl2Q3UMU9 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hdgfl2Q3UMU9 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hdgfl2Q3UMU9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hdgfl2Q3UMU9 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hdgfl2Q3UMU9 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hdgfl2Q3UMU9 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hdgfl2Q3UMU9 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Hdgfl2Q3UMU9 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Hdgfl2Q3UMU9 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Hdgfl2Q3UMU9 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Hdgfl2Q3UMU9 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Hdgfl2Q3UMU9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Hdgfl2Q3UMU9 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hdgfl2Q3UMU9 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hdgfl2Q3UMU9 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hdgfl2Q3UMU9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hdgfl2Q3UMU9 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hdgfl2Q3UMU9 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hdgfl2Q3UMU9 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hdgfl2Q3UMU9 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hdgfl2Q3UMU9 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hdgfl2Q3UMU9 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hdgfl2Q3UMU9 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Hdgfl2Q3UMU9 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hdgfl2Q3UMU9 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hdgfl2Q3UMU9 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hdgfl2Q3UMU9 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hdgfl2Q3UMU9 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hdgfl2Q3UMU9 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hdgfl2Q3UMU9 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hdgfl2Q3UMU9 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hdgfl2Q3UMU9 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hdgfl2Q3UMU9 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Hdgfl2Q3UMU9 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Hdgfl2Q3UMU9 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Hdgfl2Q3UMU9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Hdgfl2Q3UMU9 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Hdgfl2Q3UMU9 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Hdgfl2Q3UMU9 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Hdgfl2Q3UMU9 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Hdgfl2Q3UMU9 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Hdgfl2Q3UMU9 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Hdgfl2Q3UMU9 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Hdgfl2Q3UMU9 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Hdgfl2Q3UMU9 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms