Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMG5

Lrch2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrch2Q3UMG5 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrch2Q3UMG5 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrch2Q3UMG5 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrch2Q3UMG5 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrch2Q3UMG5 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrch2Q3UMG5 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrch2Q3UMG5 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrch2Q3UMG5 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrch2Q3UMG5 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrch2Q3UMG5 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrch2Q3UMG5 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrch2Q3UMG5 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrch2Q3UMG5 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrch2Q3UMG5 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrch2Q3UMG5 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrch2Q3UMG5 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrch2Q3UMG5 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrch2Q3UMG5 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrch2Q3UMG5 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrch2Q3UMG5 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrch2Q3UMG5 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrch2Q3UMG5 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrch2Q3UMG5 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrch2Q3UMG5 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrch2Q3UMG5 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrch2Q3UMG5 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrch2Q3UMG5 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrch2Q3UMG5 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrch2Q3UMG5 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrch2Q3UMG5 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrch2Q3UMG5 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrch2Q3UMG5 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrch2Q3UMG5 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrch2Q3UMG5 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrch2Q3UMG5 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrch2Q3UMG5 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrch2Q3UMG5 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrch2Q3UMG5 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrch2Q3UMG5 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrch2Q3UMG5 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrch2Q3UMG5 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrch2Q3UMG5 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrch2Q3UMG5 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrch2Q3UMG5 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrch2Q3UMG5 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrch2Q3UMG5 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrch2Q3UMG5 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrch2Q3UMG5 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrch2Q3UMG5 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrch2Q3UMG5 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrch2Q3UMG5 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrch2Q3UMG5 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrch2Q3UMG5 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrch2Q3UMG5 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrch2Q3UMG5 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrch2Q3UMG5 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrch2Q3UMG5 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrch2Q3UMG5 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Lrch2Q3UMG5 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Lrch2Q3UMG5 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Lrch2Q3UMG5 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrch2Q3UMG5 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrch2Q3UMG5 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrch2Q3UMG5 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Lrch2Q3UMG5 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrch2Q3UMG5 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Lrch2Q3UMG5 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrch2Q3UMG5 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrch2Q3UMG5 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lrch2Q3UMG5 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lrch2Q3UMG5 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lrch2Q3UMG5 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lrch2Q3UMG5 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lrch2Q3UMG5 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lrch2Q3UMG5 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lrch2Q3UMG5 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Lrch2Q3UMG5 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Lrch2Q3UMG5 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lrch2Q3UMG5 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lrch2Q3UMG5 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Lrch2Q3UMG5 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lrch2Q3UMG5 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lrch2Q3UMG5 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lrch2Q3UMG5 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Lrch2Q3UMG5 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrch2Q3UMG5 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrch2Q3UMG5 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrch2Q3UMG5 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrch2Q3UMG5 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Lrch2Q3UMG5 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrch2Q3UMG5 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrch2Q3UMG5 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrch2Q3UMG5 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrch2Q3UMG5 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrch2Q3UMG5 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrch2Q3UMG5 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrch2Q3UMG5 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Lrch2Q3UMG5 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrch2Q3UMG5 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrch2Q3UMG5 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms