Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Usp19Q3UJD6 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Usp19Q3UJD6 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Usp19Q3UJD6 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Usp19Q3UJD6 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Usp19Q3UJD6 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Usp19Q3UJD6 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Usp19Q3UJD6 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Usp19Q3UJD6 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Usp19Q3UJD6 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Usp19Q3UJD6 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Usp19Q3UJD6 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Usp19Q3UJD6 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Usp19Q3UJD6 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Usp19Q3UJD6 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Usp19Q3UJD6 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Usp19Q3UJD6 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Usp19Q3UJD6 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Usp19Q3UJD6 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Usp19Q3UJD6 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Usp19Q3UJD6 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Usp19Q3UJD6 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Usp19Q3UJD6 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Usp19Q3UJD6 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Usp19Q3UJD6 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Usp19Q3UJD6 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Usp19Q3UJD6 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Usp19Q3UJD6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Usp19Q3UJD6 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Usp19Q3UJD6 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Usp19Q3UJD6 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Usp19Q3UJD6 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Usp19Q3UJD6 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Usp19Q3UJD6 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Usp19Q3UJD6 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Usp19Q3UJD6 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Usp19Q3UJD6 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Usp19Q3UJD6 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Usp19Q3UJD6 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Usp19Q3UJD6 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Usp19Q3UJD6 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Usp19Q3UJD6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Usp19Q3UJD6 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Usp19Q3UJD6 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Usp19Q3UJD6 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Usp19Q3UJD6 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Usp19Q3UJD6 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Usp19Q3UJD6 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Usp19Q3UJD6 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Usp19Q3UJD6 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Usp19Q3UJD6 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.8
Usp19Q3UJD6 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.8
Usp19Q3UJD6 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.8
Usp19Q3UJD6 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Usp19Q3UJD6 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Usp19Q3UJD6 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Usp19Q3UJD6 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Usp19Q3UJD6 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Usp19Q3UJD6 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Usp19Q3UJD6 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Usp19Q3UJD6 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Usp19Q3UJD6 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Usp19Q3UJD6 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Usp19Q3UJD6 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Usp19Q3UJD6 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Usp19Q3UJD6 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Usp19Q3UJD6 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Usp19Q3UJD6 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Usp19Q3UJD6 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Usp19Q3UJD6 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Usp19Q3UJD6 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Usp19Q3UJD6 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Usp19Q3UJD6 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Usp19Q3UJD6 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Usp19Q3UJD6 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Usp19Q3UJD6 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Usp19Q3UJD6 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Usp19Q3UJD6 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Usp19Q3UJD6 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Usp19Q3UJD6 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Usp19Q3UJD6 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Usp19Q3UJD6 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Usp19Q3UJD6 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Usp19Q3UJD6 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Usp19Q3UJD6 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Usp19Q3UJD6 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Usp19Q3UJD6 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Usp19Q3UJD6 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Usp19Q3UJD6 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Usp19Q3UJD6 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Usp19Q3UJD6 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Usp19Q3UJD6 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Usp19Q3UJD6 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Usp19Q3UJD6 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Usp19Q3UJD6 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Usp19Q3UJD6 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Usp19Q3UJD6 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Usp19Q3UJD6 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Usp19Q3UJD6 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Usp19Q3UJD6 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95 ms