Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB9

Edc4, Enhancer of mRNA-decapping protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edc4Q3UJB9 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Edc4Q3UJB9 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Edc4Q3UJB9 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Edc4Q3UJB9 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Edc4Q3UJB9 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Edc4Q3UJB9 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Edc4Q3UJB9 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Edc4Q3UJB9 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Edc4Q3UJB9 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Edc4Q3UJB9 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Edc4Q3UJB9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Edc4Q3UJB9 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Edc4Q3UJB9 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Edc4Q3UJB9 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Edc4Q3UJB9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Edc4Q3UJB9 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Edc4Q3UJB9 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Edc4Q3UJB9 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Edc4Q3UJB9 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Edc4Q3UJB9 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Edc4Q3UJB9 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Edc4Q3UJB9 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Edc4Q3UJB9 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Edc4Q3UJB9 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Edc4Q3UJB9 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Edc4Q3UJB9 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Edc4Q3UJB9 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Edc4Q3UJB9 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Edc4Q3UJB9 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Edc4Q3UJB9 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Edc4Q3UJB9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Edc4Q3UJB9 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Edc4Q3UJB9 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Edc4Q3UJB9 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Edc4Q3UJB9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Edc4Q3UJB9 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Edc4Q3UJB9 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Edc4Q3UJB9 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Edc4Q3UJB9 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Edc4Q3UJB9 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Edc4Q3UJB9 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Edc4Q3UJB9 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Edc4Q3UJB9 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Edc4Q3UJB9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Edc4Q3UJB9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Edc4Q3UJB9 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Edc4Q3UJB9 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Edc4Q3UJB9 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Edc4Q3UJB9 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Edc4Q3UJB9 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Edc4Q3UJB9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Edc4Q3UJB9 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Edc4Q3UJB9 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Edc4Q3UJB9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Edc4Q3UJB9 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Edc4Q3UJB9 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Edc4Q3UJB9 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Edc4Q3UJB9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Edc4Q3UJB9 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Edc4Q3UJB9 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Edc4Q3UJB9 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Edc4Q3UJB9 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Edc4Q3UJB9 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Edc4Q3UJB9 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Edc4Q3UJB9 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Edc4Q3UJB9 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Edc4Q3UJB9 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Edc4Q3UJB9 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Edc4Q3UJB9 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Edc4Q3UJB9 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Edc4Q3UJB9 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Edc4Q3UJB9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Edc4Q3UJB9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Edc4Q3UJB9 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Edc4Q3UJB9 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Edc4Q3UJB9 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Edc4Q3UJB9 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Edc4Q3UJB9 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Edc4Q3UJB9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Edc4Q3UJB9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Edc4Q3UJB9 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Edc4Q3UJB9 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Edc4Q3UJB9 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Edc4Q3UJB9 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Edc4Q3UJB9 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Edc4Q3UJB9 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Edc4Q3UJB9 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Edc4Q3UJB9 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Edc4Q3UJB9 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Edc4Q3UJB9 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Edc4Q3UJB9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Edc4Q3UJB9 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Edc4Q3UJB9 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Edc4Q3UJB9 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Edc4Q3UJB9 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Edc4Q3UJB9 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Edc4Q3UJB9 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Edc4Q3UJB9 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Edc4Q3UJB9 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Edc4Q3UJB9 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms