Protein–RNA interactions for Protein: Q3UIR3

Dtx3l, E3 ubiquitin-protein ligase DTX3L, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dtx3lQ3UIR3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Dtx3lQ3UIR3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Dtx3lQ3UIR3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Dtx3lQ3UIR3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Dtx3lQ3UIR3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Dtx3lQ3UIR3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Dtx3lQ3UIR3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Dtx3lQ3UIR3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Dtx3lQ3UIR3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Dtx3lQ3UIR3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Dtx3lQ3UIR3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Dtx3lQ3UIR3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Dtx3lQ3UIR3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Dtx3lQ3UIR3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Dtx3lQ3UIR3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Dtx3lQ3UIR3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Dtx3lQ3UIR3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Dtx3lQ3UIR3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Dtx3lQ3UIR3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Dtx3lQ3UIR3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Dtx3lQ3UIR3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Dtx3lQ3UIR3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Dtx3lQ3UIR3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Dtx3lQ3UIR3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Dtx3lQ3UIR3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Dtx3lQ3UIR3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Dtx3lQ3UIR3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Dtx3lQ3UIR3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Dtx3lQ3UIR3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Dtx3lQ3UIR3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Dtx3lQ3UIR3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Dtx3lQ3UIR3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Dtx3lQ3UIR3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Dtx3lQ3UIR3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Dtx3lQ3UIR3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Dtx3lQ3UIR3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Dtx3lQ3UIR3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Dtx3lQ3UIR3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Dtx3lQ3UIR3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Dtx3lQ3UIR3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Dtx3lQ3UIR3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Dtx3lQ3UIR3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Dtx3lQ3UIR3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Dtx3lQ3UIR3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Dtx3lQ3UIR3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Dtx3lQ3UIR3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Dtx3lQ3UIR3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Dtx3lQ3UIR3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Dtx3lQ3UIR3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Dtx3lQ3UIR3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Dtx3lQ3UIR3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Dtx3lQ3UIR3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Dtx3lQ3UIR3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Dtx3lQ3UIR3 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Dtx3lQ3UIR3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Dtx3lQ3UIR3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Dtx3lQ3UIR3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Dtx3lQ3UIR3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Dtx3lQ3UIR3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Dtx3lQ3UIR3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Dtx3lQ3UIR3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Dtx3lQ3UIR3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Dtx3lQ3UIR3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Dtx3lQ3UIR3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Dtx3lQ3UIR3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Dtx3lQ3UIR3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Dtx3lQ3UIR3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Dtx3lQ3UIR3 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Dtx3lQ3UIR3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Dtx3lQ3UIR3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Dtx3lQ3UIR3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Dtx3lQ3UIR3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Dtx3lQ3UIR3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Dtx3lQ3UIR3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Dtx3lQ3UIR3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Dtx3lQ3UIR3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Dtx3lQ3UIR3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Dtx3lQ3UIR3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Dtx3lQ3UIR3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Dtx3lQ3UIR3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Dtx3lQ3UIR3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Dtx3lQ3UIR3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Dtx3lQ3UIR3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Dtx3lQ3UIR3 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Dtx3lQ3UIR3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Dtx3lQ3UIR3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Dtx3lQ3UIR3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Dtx3lQ3UIR3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Dtx3lQ3UIR3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Dtx3lQ3UIR3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Dtx3lQ3UIR3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Dtx3lQ3UIR3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Dtx3lQ3UIR3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Dtx3lQ3UIR3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Dtx3lQ3UIR3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Dtx3lQ3UIR3 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Dtx3lQ3UIR3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Dtx3lQ3UIR3 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Dtx3lQ3UIR3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Dtx3lQ3UIR3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms