Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc34Q3UI66 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc34Q3UI66 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc34Q3UI66 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc34Q3UI66 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc34Q3UI66 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc34Q3UI66 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc34Q3UI66 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc34Q3UI66 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc34Q3UI66 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc34Q3UI66 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc34Q3UI66 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc34Q3UI66 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc34Q3UI66 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc34Q3UI66 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc34Q3UI66 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc34Q3UI66 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc34Q3UI66 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc34Q3UI66 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc34Q3UI66 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc34Q3UI66 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc34Q3UI66 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc34Q3UI66 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc34Q3UI66 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc34Q3UI66 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc34Q3UI66 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc34Q3UI66 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc34Q3UI66 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc34Q3UI66 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc34Q3UI66 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc34Q3UI66 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc34Q3UI66 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc34Q3UI66 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc34Q3UI66 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc34Q3UI66 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc34Q3UI66 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc34Q3UI66 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc34Q3UI66 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc34Q3UI66 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc34Q3UI66 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc34Q3UI66 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc34Q3UI66 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc34Q3UI66 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc34Q3UI66 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc34Q3UI66 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc34Q3UI66 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc34Q3UI66 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc34Q3UI66 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc34Q3UI66 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc34Q3UI66 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc34Q3UI66 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc34Q3UI66 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc34Q3UI66 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc34Q3UI66 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc34Q3UI66 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc34Q3UI66 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc34Q3UI66 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc34Q3UI66 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc34Q3UI66 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc34Q3UI66 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc34Q3UI66 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc34Q3UI66 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc34Q3UI66 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc34Q3UI66 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc34Q3UI66 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc34Q3UI66 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc34Q3UI66 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc34Q3UI66 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc34Q3UI66 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc34Q3UI66 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc34Q3UI66 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc34Q3UI66 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc34Q3UI66 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc34Q3UI66 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc34Q3UI66 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc34Q3UI66 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc34Q3UI66 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc34Q3UI66 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc34Q3UI66 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc34Q3UI66 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc34Q3UI66 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc34Q3UI66 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc34Q3UI66 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc34Q3UI66 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc34Q3UI66 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc34Q3UI66 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc34Q3UI66 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc34Q3UI66 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc34Q3UI66 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc34Q3UI66 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc34Q3UI66 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc34Q3UI66 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc34Q3UI66 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc34Q3UI66 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc34Q3UI66 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc34Q3UI66 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc34Q3UI66 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc34Q3UI66 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc34Q3UI66 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc34Q3UI66 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms