Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snx27Q3UHD6 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snx27Q3UHD6 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snx27Q3UHD6 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snx27Q3UHD6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snx27Q3UHD6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snx27Q3UHD6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snx27Q3UHD6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snx27Q3UHD6 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Snx27Q3UHD6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snx27Q3UHD6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snx27Q3UHD6 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snx27Q3UHD6 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snx27Q3UHD6 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snx27Q3UHD6 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snx27Q3UHD6 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snx27Q3UHD6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snx27Q3UHD6 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Snx27Q3UHD6 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snx27Q3UHD6 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snx27Q3UHD6 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snx27Q3UHD6 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snx27Q3UHD6 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snx27Q3UHD6 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snx27Q3UHD6 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snx27Q3UHD6 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snx27Q3UHD6 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Snx27Q3UHD6 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snx27Q3UHD6 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snx27Q3UHD6 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snx27Q3UHD6 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snx27Q3UHD6 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snx27Q3UHD6 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snx27Q3UHD6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snx27Q3UHD6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snx27Q3UHD6 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snx27Q3UHD6 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snx27Q3UHD6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snx27Q3UHD6 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Snx27Q3UHD6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snx27Q3UHD6 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snx27Q3UHD6 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snx27Q3UHD6 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Snx27Q3UHD6 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snx27Q3UHD6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snx27Q3UHD6 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snx27Q3UHD6 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snx27Q3UHD6 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snx27Q3UHD6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snx27Q3UHD6 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snx27Q3UHD6 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snx27Q3UHD6 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snx27Q3UHD6 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snx27Q3UHD6 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snx27Q3UHD6 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Snx27Q3UHD6 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snx27Q3UHD6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Snx27Q3UHD6 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Snx27Q3UHD6 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Snx27Q3UHD6 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Snx27Q3UHD6 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Snx27Q3UHD6 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Snx27Q3UHD6 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Snx27Q3UHD6 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Snx27Q3UHD6 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Snx27Q3UHD6 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Snx27Q3UHD6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Snx27Q3UHD6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Snx27Q3UHD6 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Snx27Q3UHD6 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Snx27Q3UHD6 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snx27Q3UHD6 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Snx27Q3UHD6 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snx27Q3UHD6 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snx27Q3UHD6 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snx27Q3UHD6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snx27Q3UHD6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snx27Q3UHD6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snx27Q3UHD6 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snx27Q3UHD6 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snx27Q3UHD6 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snx27Q3UHD6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snx27Q3UHD6 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snx27Q3UHD6 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snx27Q3UHD6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snx27Q3UHD6 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snx27Q3UHD6 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snx27Q3UHD6 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snx27Q3UHD6 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Snx27Q3UHD6 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Snx27Q3UHD6 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snx27Q3UHD6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snx27Q3UHD6 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snx27Q3UHD6 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snx27Q3UHD6 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snx27Q3UHD6 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snx27Q3UHD6 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snx27Q3UHD6 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snx27Q3UHD6 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snx27Q3UHD6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 126.7 ms