Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFY4

Rsph3a, Radial spoke head protein 3 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph3aQ3UFY4 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Rsph3aQ3UFY4 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Rsph3aQ3UFY4 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Rsph3aQ3UFY4 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rsph3aQ3UFY4 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rsph3aQ3UFY4 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rsph3aQ3UFY4 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rsph3aQ3UFY4 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rsph3aQ3UFY4 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rsph3aQ3UFY4 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rsph3aQ3UFY4 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rsph3aQ3UFY4 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rsph3aQ3UFY4 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rsph3aQ3UFY4 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rsph3aQ3UFY4 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rsph3aQ3UFY4 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rsph3aQ3UFY4 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rsph3aQ3UFY4 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rsph3aQ3UFY4 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rsph3aQ3UFY4 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rsph3aQ3UFY4 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rsph3aQ3UFY4 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rsph3aQ3UFY4 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rsph3aQ3UFY4 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rsph3aQ3UFY4 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rsph3aQ3UFY4 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rsph3aQ3UFY4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rsph3aQ3UFY4 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rsph3aQ3UFY4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rsph3aQ3UFY4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rsph3aQ3UFY4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rsph3aQ3UFY4 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rsph3aQ3UFY4 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rsph3aQ3UFY4 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rsph3aQ3UFY4 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rsph3aQ3UFY4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rsph3aQ3UFY4 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rsph3aQ3UFY4 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rsph3aQ3UFY4 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rsph3aQ3UFY4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rsph3aQ3UFY4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Rsph3aQ3UFY4 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rsph3aQ3UFY4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rsph3aQ3UFY4 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rsph3aQ3UFY4 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rsph3aQ3UFY4 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rsph3aQ3UFY4 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rsph3aQ3UFY4 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Rsph3aQ3UFY4 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Rsph3aQ3UFY4 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rsph3aQ3UFY4 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rsph3aQ3UFY4 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rsph3aQ3UFY4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rsph3aQ3UFY4 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rsph3aQ3UFY4 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rsph3aQ3UFY4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rsph3aQ3UFY4 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rsph3aQ3UFY4 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rsph3aQ3UFY4 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rsph3aQ3UFY4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rsph3aQ3UFY4 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rsph3aQ3UFY4 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rsph3aQ3UFY4 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rsph3aQ3UFY4 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rsph3aQ3UFY4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rsph3aQ3UFY4 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rsph3aQ3UFY4 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rsph3aQ3UFY4 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rsph3aQ3UFY4 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rsph3aQ3UFY4 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rsph3aQ3UFY4 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Rsph3aQ3UFY4 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rsph3aQ3UFY4 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rsph3aQ3UFY4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rsph3aQ3UFY4 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rsph3aQ3UFY4 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rsph3aQ3UFY4 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rsph3aQ3UFY4 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rsph3aQ3UFY4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rsph3aQ3UFY4 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rsph3aQ3UFY4 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rsph3aQ3UFY4 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rsph3aQ3UFY4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rsph3aQ3UFY4 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rsph3aQ3UFY4 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rsph3aQ3UFY4 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rsph3aQ3UFY4 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Rsph3aQ3UFY4 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Rsph3aQ3UFY4 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rsph3aQ3UFY4 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rsph3aQ3UFY4 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rsph3aQ3UFY4 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rsph3aQ3UFY4 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rsph3aQ3UFY4 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rsph3aQ3UFY4 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rsph3aQ3UFY4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rsph3aQ3UFY4 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rsph3aQ3UFY4 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rsph3aQ3UFY4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rsph3aQ3UFY4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms