Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFS0

Zyg11b, Protein zyg-11 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zyg11bQ3UFS0 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zyg11bQ3UFS0 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Zyg11bQ3UFS0 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zyg11bQ3UFS0 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zyg11bQ3UFS0 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zyg11bQ3UFS0 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zyg11bQ3UFS0 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Zyg11bQ3UFS0 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Zyg11bQ3UFS0 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zyg11bQ3UFS0 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zyg11bQ3UFS0 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zyg11bQ3UFS0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zyg11bQ3UFS0 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zyg11bQ3UFS0 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zyg11bQ3UFS0 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Zyg11bQ3UFS0 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zyg11bQ3UFS0 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zyg11bQ3UFS0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zyg11bQ3UFS0 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zyg11bQ3UFS0 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zyg11bQ3UFS0 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zyg11bQ3UFS0 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Zyg11bQ3UFS0 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zyg11bQ3UFS0 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zyg11bQ3UFS0 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zyg11bQ3UFS0 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zyg11bQ3UFS0 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zyg11bQ3UFS0 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zyg11bQ3UFS0 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Zyg11bQ3UFS0 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Zyg11bQ3UFS0 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Zyg11bQ3UFS0 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Zyg11bQ3UFS0 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Zyg11bQ3UFS0 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Zyg11bQ3UFS0 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Zyg11bQ3UFS0 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Zyg11bQ3UFS0 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zyg11bQ3UFS0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zyg11bQ3UFS0 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zyg11bQ3UFS0 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zyg11bQ3UFS0 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zyg11bQ3UFS0 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zyg11bQ3UFS0 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zyg11bQ3UFS0 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zyg11bQ3UFS0 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zyg11bQ3UFS0 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Zyg11bQ3UFS0 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zyg11bQ3UFS0 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Zyg11bQ3UFS0 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Zyg11bQ3UFS0 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Zyg11bQ3UFS0 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zyg11bQ3UFS0 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zyg11bQ3UFS0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zyg11bQ3UFS0 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zyg11bQ3UFS0 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zyg11bQ3UFS0 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zyg11bQ3UFS0 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zyg11bQ3UFS0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zyg11bQ3UFS0 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zyg11bQ3UFS0 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zyg11bQ3UFS0 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zyg11bQ3UFS0 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zyg11bQ3UFS0 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zyg11bQ3UFS0 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zyg11bQ3UFS0 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zyg11bQ3UFS0 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zyg11bQ3UFS0 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zyg11bQ3UFS0 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zyg11bQ3UFS0 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zyg11bQ3UFS0 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zyg11bQ3UFS0 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zyg11bQ3UFS0 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zyg11bQ3UFS0 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zyg11bQ3UFS0 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zyg11bQ3UFS0 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zyg11bQ3UFS0 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zyg11bQ3UFS0 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zyg11bQ3UFS0 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zyg11bQ3UFS0 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zyg11bQ3UFS0 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zyg11bQ3UFS0 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zyg11bQ3UFS0 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zyg11bQ3UFS0 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zyg11bQ3UFS0 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zyg11bQ3UFS0 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zyg11bQ3UFS0 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Zyg11bQ3UFS0 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Zyg11bQ3UFS0 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zyg11bQ3UFS0 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zyg11bQ3UFS0 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zyg11bQ3UFS0 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Zyg11bQ3UFS0 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zyg11bQ3UFS0 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zyg11bQ3UFS0 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zyg11bQ3UFS0 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zyg11bQ3UFS0 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zyg11bQ3UFS0 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zyg11bQ3UFS0 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zyg11bQ3UFS0 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zyg11bQ3UFS0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms