Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Puf60Q3UEB3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Puf60Q3UEB3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Puf60Q3UEB3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Puf60Q3UEB3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Puf60Q3UEB3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Puf60Q3UEB3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Puf60Q3UEB3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Puf60Q3UEB3 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Puf60Q3UEB3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Puf60Q3UEB3 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Puf60Q3UEB3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Puf60Q3UEB3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Puf60Q3UEB3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Puf60Q3UEB3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Puf60Q3UEB3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Puf60Q3UEB3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Puf60Q3UEB3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Puf60Q3UEB3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Puf60Q3UEB3 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Puf60Q3UEB3 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Puf60Q3UEB3 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Puf60Q3UEB3 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Puf60Q3UEB3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Puf60Q3UEB3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Puf60Q3UEB3 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Puf60Q3UEB3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Puf60Q3UEB3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Puf60Q3UEB3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Puf60Q3UEB3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Puf60Q3UEB3 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Puf60Q3UEB3 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Puf60Q3UEB3 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Puf60Q3UEB3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Puf60Q3UEB3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Puf60Q3UEB3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Puf60Q3UEB3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Puf60Q3UEB3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Puf60Q3UEB3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Puf60Q3UEB3 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Puf60Q3UEB3 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Puf60Q3UEB3 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Puf60Q3UEB3 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Puf60Q3UEB3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Puf60Q3UEB3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Puf60Q3UEB3 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Puf60Q3UEB3 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Puf60Q3UEB3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Puf60Q3UEB3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Puf60Q3UEB3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Puf60Q3UEB3 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Puf60Q3UEB3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Puf60Q3UEB3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Puf60Q3UEB3 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Puf60Q3UEB3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Puf60Q3UEB3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Puf60Q3UEB3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Puf60Q3UEB3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Puf60Q3UEB3 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Puf60Q3UEB3 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Puf60Q3UEB3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Puf60Q3UEB3 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Puf60Q3UEB3 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Puf60Q3UEB3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Puf60Q3UEB3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Puf60Q3UEB3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Puf60Q3UEB3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Puf60Q3UEB3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Puf60Q3UEB3 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Puf60Q3UEB3 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Puf60Q3UEB3 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Puf60Q3UEB3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Puf60Q3UEB3 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Puf60Q3UEB3 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Puf60Q3UEB3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Puf60Q3UEB3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Puf60Q3UEB3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Puf60Q3UEB3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Puf60Q3UEB3 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Puf60Q3UEB3 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Puf60Q3UEB3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Puf60Q3UEB3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Puf60Q3UEB3 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Puf60Q3UEB3 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Puf60Q3UEB3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Puf60Q3UEB3 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Puf60Q3UEB3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Puf60Q3UEB3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Puf60Q3UEB3 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Puf60Q3UEB3 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Puf60Q3UEB3 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Puf60Q3UEB3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Puf60Q3UEB3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Puf60Q3UEB3 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Puf60Q3UEB3 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Puf60Q3UEB3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Puf60Q3UEB3 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Puf60Q3UEB3 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Puf60Q3UEB3 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Puf60Q3UEB3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms