Protein–RNA interactions for Protein: Q3UA06

Trip13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip13Q3UA06 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trip13Q3UA06 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trip13Q3UA06 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trip13Q3UA06 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trip13Q3UA06 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trip13Q3UA06 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trip13Q3UA06 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Trip13Q3UA06 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trip13Q3UA06 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trip13Q3UA06 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Trip13Q3UA06 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trip13Q3UA06 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trip13Q3UA06 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trip13Q3UA06 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trip13Q3UA06 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Trip13Q3UA06 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Trip13Q3UA06 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trip13Q3UA06 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trip13Q3UA06 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Trip13Q3UA06 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trip13Q3UA06 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trip13Q3UA06 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trip13Q3UA06 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Trip13Q3UA06 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trip13Q3UA06 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Trip13Q3UA06 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trip13Q3UA06 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Trip13Q3UA06 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trip13Q3UA06 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trip13Q3UA06 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Trip13Q3UA06 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trip13Q3UA06 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trip13Q3UA06 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trip13Q3UA06 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trip13Q3UA06 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trip13Q3UA06 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Trip13Q3UA06 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Trip13Q3UA06 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Trip13Q3UA06 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Trip13Q3UA06 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Trip13Q3UA06 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trip13Q3UA06 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trip13Q3UA06 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trip13Q3UA06 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trip13Q3UA06 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trip13Q3UA06 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trip13Q3UA06 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trip13Q3UA06 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trip13Q3UA06 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trip13Q3UA06 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trip13Q3UA06 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trip13Q3UA06 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trip13Q3UA06 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trip13Q3UA06 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trip13Q3UA06 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trip13Q3UA06 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trip13Q3UA06 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trip13Q3UA06 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trip13Q3UA06 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trip13Q3UA06 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trip13Q3UA06 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trip13Q3UA06 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trip13Q3UA06 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trip13Q3UA06 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trip13Q3UA06 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trip13Q3UA06 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trip13Q3UA06 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trip13Q3UA06 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trip13Q3UA06 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trip13Q3UA06 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trip13Q3UA06 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trip13Q3UA06 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trip13Q3UA06 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trip13Q3UA06 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trip13Q3UA06 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trip13Q3UA06 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trip13Q3UA06 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Trip13Q3UA06 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Trip13Q3UA06 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trip13Q3UA06 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trip13Q3UA06 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trip13Q3UA06 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trip13Q3UA06 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trip13Q3UA06 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trip13Q3UA06 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trip13Q3UA06 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trip13Q3UA06 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trip13Q3UA06 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trip13Q3UA06 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trip13Q3UA06 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trip13Q3UA06 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trip13Q3UA06 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trip13Q3UA06 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trip13Q3UA06 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trip13Q3UA06 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trip13Q3UA06 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trip13Q3UA06 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Trip13Q3UA06 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trip13Q3UA06 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trip13Q3UA06 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms