Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gtpbp6Q3U6U5 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gtpbp6Q3U6U5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gtpbp6Q3U6U5 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gtpbp6Q3U6U5 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gtpbp6Q3U6U5 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gtpbp6Q3U6U5 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gtpbp6Q3U6U5 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gtpbp6Q3U6U5 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gtpbp6Q3U6U5 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gtpbp6Q3U6U5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gtpbp6Q3U6U5 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Gtpbp6Q3U6U5 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gtpbp6Q3U6U5 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gtpbp6Q3U6U5 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gtpbp6Q3U6U5 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gtpbp6Q3U6U5 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Gtpbp6Q3U6U5 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gtpbp6Q3U6U5 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gtpbp6Q3U6U5 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gtpbp6Q3U6U5 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gtpbp6Q3U6U5 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gtpbp6Q3U6U5 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gtpbp6Q3U6U5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Gtpbp6Q3U6U5 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gtpbp6Q3U6U5 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gtpbp6Q3U6U5 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gtpbp6Q3U6U5 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gtpbp6Q3U6U5 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Gtpbp6Q3U6U5 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gtpbp6Q3U6U5 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Gtpbp6Q3U6U5 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gtpbp6Q3U6U5 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Gtpbp6Q3U6U5 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gtpbp6Q3U6U5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gtpbp6Q3U6U5 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gtpbp6Q3U6U5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gtpbp6Q3U6U5 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gtpbp6Q3U6U5 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gtpbp6Q3U6U5 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gtpbp6Q3U6U5 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Gtpbp6Q3U6U5 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gtpbp6Q3U6U5 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gtpbp6Q3U6U5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gtpbp6Q3U6U5 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gtpbp6Q3U6U5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gtpbp6Q3U6U5 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gtpbp6Q3U6U5 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gtpbp6Q3U6U5 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Gtpbp6Q3U6U5 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gtpbp6Q3U6U5 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gtpbp6Q3U6U5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gtpbp6Q3U6U5 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gtpbp6Q3U6U5 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gtpbp6Q3U6U5 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gtpbp6Q3U6U5 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gtpbp6Q3U6U5 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gtpbp6Q3U6U5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gtpbp6Q3U6U5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gtpbp6Q3U6U5 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gtpbp6Q3U6U5 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gtpbp6Q3U6U5 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Gtpbp6Q3U6U5 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gtpbp6Q3U6U5 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gtpbp6Q3U6U5 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gtpbp6Q3U6U5 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Gtpbp6Q3U6U5 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gtpbp6Q3U6U5 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gtpbp6Q3U6U5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gtpbp6Q3U6U5 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gtpbp6Q3U6U5 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gtpbp6Q3U6U5 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gtpbp6Q3U6U5 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gtpbp6Q3U6U5 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gtpbp6Q3U6U5 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gtpbp6Q3U6U5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gtpbp6Q3U6U5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gtpbp6Q3U6U5 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gtpbp6Q3U6U5 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gtpbp6Q3U6U5 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gtpbp6Q3U6U5 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gtpbp6Q3U6U5 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gtpbp6Q3U6U5 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gtpbp6Q3U6U5 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gtpbp6Q3U6U5 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gtpbp6Q3U6U5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gtpbp6Q3U6U5 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Gtpbp6Q3U6U5 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
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