Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3C9

Gse1, Genetic suppressor element 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gse1Q3U3C9 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gse1Q3U3C9 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gse1Q3U3C9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gse1Q3U3C9 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gse1Q3U3C9 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gse1Q3U3C9 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gse1Q3U3C9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gse1Q3U3C9 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gse1Q3U3C9 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gse1Q3U3C9 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gse1Q3U3C9 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gse1Q3U3C9 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gse1Q3U3C9 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gse1Q3U3C9 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gse1Q3U3C9 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gse1Q3U3C9 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gse1Q3U3C9 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gse1Q3U3C9 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gse1Q3U3C9 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gse1Q3U3C9 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gse1Q3U3C9 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gse1Q3U3C9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gse1Q3U3C9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gse1Q3U3C9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gse1Q3U3C9 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gse1Q3U3C9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gse1Q3U3C9 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gse1Q3U3C9 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gse1Q3U3C9 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gse1Q3U3C9 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gse1Q3U3C9 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gse1Q3U3C9 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gse1Q3U3C9 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gse1Q3U3C9 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gse1Q3U3C9 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gse1Q3U3C9 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gse1Q3U3C9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gse1Q3U3C9 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gse1Q3U3C9 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gse1Q3U3C9 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gse1Q3U3C9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gse1Q3U3C9 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gse1Q3U3C9 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gse1Q3U3C9 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gse1Q3U3C9 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gse1Q3U3C9 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gse1Q3U3C9 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gse1Q3U3C9 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gse1Q3U3C9 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gse1Q3U3C9 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gse1Q3U3C9 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gse1Q3U3C9 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gse1Q3U3C9 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gse1Q3U3C9 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gse1Q3U3C9 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gse1Q3U3C9 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Gse1Q3U3C9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gse1Q3U3C9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gse1Q3U3C9 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gse1Q3U3C9 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gse1Q3U3C9 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gse1Q3U3C9 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gse1Q3U3C9 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gse1Q3U3C9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gse1Q3U3C9 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gse1Q3U3C9 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gse1Q3U3C9 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Gse1Q3U3C9 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gse1Q3U3C9 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gse1Q3U3C9 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gse1Q3U3C9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gse1Q3U3C9 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gse1Q3U3C9 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gse1Q3U3C9 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gse1Q3U3C9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gse1Q3U3C9 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gse1Q3U3C9 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gse1Q3U3C9 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gse1Q3U3C9 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gse1Q3U3C9 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Gse1Q3U3C9 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gse1Q3U3C9 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Gse1Q3U3C9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gse1Q3U3C9 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gse1Q3U3C9 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gse1Q3U3C9 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gse1Q3U3C9 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Gse1Q3U3C9 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gse1Q3U3C9 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gse1Q3U3C9 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gse1Q3U3C9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gse1Q3U3C9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gse1Q3U3C9 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gse1Q3U3C9 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gse1Q3U3C9 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gse1Q3U3C9 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Gse1Q3U3C9 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gse1Q3U3C9 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gse1Q3U3C9 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gse1Q3U3C9 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms