Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S8

Hvcn1, Voltage-gated hydrogen channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hvcn1Q3U2S8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hvcn1Q3U2S8 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hvcn1Q3U2S8 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hvcn1Q3U2S8 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hvcn1Q3U2S8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hvcn1Q3U2S8 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hvcn1Q3U2S8 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hvcn1Q3U2S8 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hvcn1Q3U2S8 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Hvcn1Q3U2S8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hvcn1Q3U2S8 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hvcn1Q3U2S8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hvcn1Q3U2S8 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hvcn1Q3U2S8 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hvcn1Q3U2S8 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hvcn1Q3U2S8 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hvcn1Q3U2S8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hvcn1Q3U2S8 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hvcn1Q3U2S8 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hvcn1Q3U2S8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hvcn1Q3U2S8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hvcn1Q3U2S8 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hvcn1Q3U2S8 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hvcn1Q3U2S8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hvcn1Q3U2S8 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hvcn1Q3U2S8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hvcn1Q3U2S8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hvcn1Q3U2S8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hvcn1Q3U2S8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hvcn1Q3U2S8 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hvcn1Q3U2S8 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hvcn1Q3U2S8 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hvcn1Q3U2S8 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hvcn1Q3U2S8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hvcn1Q3U2S8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hvcn1Q3U2S8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hvcn1Q3U2S8 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hvcn1Q3U2S8 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hvcn1Q3U2S8 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hvcn1Q3U2S8 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hvcn1Q3U2S8 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hvcn1Q3U2S8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hvcn1Q3U2S8 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hvcn1Q3U2S8 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hvcn1Q3U2S8 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hvcn1Q3U2S8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hvcn1Q3U2S8 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hvcn1Q3U2S8 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hvcn1Q3U2S8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hvcn1Q3U2S8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hvcn1Q3U2S8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hvcn1Q3U2S8 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hvcn1Q3U2S8 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hvcn1Q3U2S8 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hvcn1Q3U2S8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hvcn1Q3U2S8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hvcn1Q3U2S8 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hvcn1Q3U2S8 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hvcn1Q3U2S8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Hvcn1Q3U2S8 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hvcn1Q3U2S8 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hvcn1Q3U2S8 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hvcn1Q3U2S8 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hvcn1Q3U2S8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hvcn1Q3U2S8 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hvcn1Q3U2S8 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hvcn1Q3U2S8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Hvcn1Q3U2S8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hvcn1Q3U2S8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Hvcn1Q3U2S8 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hvcn1Q3U2S8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hvcn1Q3U2S8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hvcn1Q3U2S8 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hvcn1Q3U2S8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hvcn1Q3U2S8 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hvcn1Q3U2S8 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hvcn1Q3U2S8 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hvcn1Q3U2S8 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hvcn1Q3U2S8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hvcn1Q3U2S8 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hvcn1Q3U2S8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hvcn1Q3U2S8 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hvcn1Q3U2S8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hvcn1Q3U2S8 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hvcn1Q3U2S8 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hvcn1Q3U2S8 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hvcn1Q3U2S8 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hvcn1Q3U2S8 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hvcn1Q3U2S8 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hvcn1Q3U2S8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hvcn1Q3U2S8 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hvcn1Q3U2S8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hvcn1Q3U2S8 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hvcn1Q3U2S8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hvcn1Q3U2S8 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hvcn1Q3U2S8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hvcn1Q3U2S8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hvcn1Q3U2S8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hvcn1Q3U2S8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hvcn1Q3U2S8 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms