Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0S6

Rasip1, Ras-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasip1Q3U0S6 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rasip1Q3U0S6 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rasip1Q3U0S6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rasip1Q3U0S6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rasip1Q3U0S6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rasip1Q3U0S6 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rasip1Q3U0S6 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rasip1Q3U0S6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rasip1Q3U0S6 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rasip1Q3U0S6 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rasip1Q3U0S6 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rasip1Q3U0S6 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rasip1Q3U0S6 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rasip1Q3U0S6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rasip1Q3U0S6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rasip1Q3U0S6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rasip1Q3U0S6 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rasip1Q3U0S6 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rasip1Q3U0S6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rasip1Q3U0S6 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rasip1Q3U0S6 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rasip1Q3U0S6 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rasip1Q3U0S6 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Rasip1Q3U0S6 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Rasip1Q3U0S6 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rasip1Q3U0S6 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rasip1Q3U0S6 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rasip1Q3U0S6 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rasip1Q3U0S6 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rasip1Q3U0S6 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rasip1Q3U0S6 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rasip1Q3U0S6 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rasip1Q3U0S6 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rasip1Q3U0S6 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Rasip1Q3U0S6 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rasip1Q3U0S6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rasip1Q3U0S6 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rasip1Q3U0S6 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rasip1Q3U0S6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rasip1Q3U0S6 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rasip1Q3U0S6 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Rasip1Q3U0S6 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rasip1Q3U0S6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rasip1Q3U0S6 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rasip1Q3U0S6 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Rasip1Q3U0S6 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rasip1Q3U0S6 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rasip1Q3U0S6 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rasip1Q3U0S6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rasip1Q3U0S6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rasip1Q3U0S6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rasip1Q3U0S6 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rasip1Q3U0S6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rasip1Q3U0S6 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rasip1Q3U0S6 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rasip1Q3U0S6 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rasip1Q3U0S6 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rasip1Q3U0S6 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rasip1Q3U0S6 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rasip1Q3U0S6 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rasip1Q3U0S6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Rasip1Q3U0S6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Rasip1Q3U0S6 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rasip1Q3U0S6 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Rasip1Q3U0S6 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rasip1Q3U0S6 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rasip1Q3U0S6 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rasip1Q3U0S6 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rasip1Q3U0S6 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rasip1Q3U0S6 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rasip1Q3U0S6 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rasip1Q3U0S6 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rasip1Q3U0S6 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rasip1Q3U0S6 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rasip1Q3U0S6 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rasip1Q3U0S6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rasip1Q3U0S6 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rasip1Q3U0S6 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Rasip1Q3U0S6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rasip1Q3U0S6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rasip1Q3U0S6 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rasip1Q3U0S6 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rasip1Q3U0S6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rasip1Q3U0S6 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rasip1Q3U0S6 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rasip1Q3U0S6 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rasip1Q3U0S6 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rasip1Q3U0S6 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rasip1Q3U0S6 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rasip1Q3U0S6 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rasip1Q3U0S6 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rasip1Q3U0S6 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rasip1Q3U0S6 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rasip1Q3U0S6 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rasip1Q3U0S6 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rasip1Q3U0S6 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rasip1Q3U0S6 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Rasip1Q3U0S6 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rasip1Q3U0S6 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rasip1Q3U0S6 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms