Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0P1

Palb2, Partner and localizer of BRCA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palb2Q3U0P1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Palb2Q3U0P1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Palb2Q3U0P1 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Palb2Q3U0P1 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Palb2Q3U0P1 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Palb2Q3U0P1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Palb2Q3U0P1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Palb2Q3U0P1 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Palb2Q3U0P1 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Palb2Q3U0P1 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Palb2Q3U0P1 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Palb2Q3U0P1 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Palb2Q3U0P1 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Palb2Q3U0P1 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Palb2Q3U0P1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Palb2Q3U0P1 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Palb2Q3U0P1 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Palb2Q3U0P1 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Palb2Q3U0P1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Palb2Q3U0P1 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Palb2Q3U0P1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Palb2Q3U0P1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Palb2Q3U0P1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Palb2Q3U0P1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Palb2Q3U0P1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Palb2Q3U0P1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Palb2Q3U0P1 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Palb2Q3U0P1 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Palb2Q3U0P1 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Palb2Q3U0P1 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Palb2Q3U0P1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Palb2Q3U0P1 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Palb2Q3U0P1 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Palb2Q3U0P1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Palb2Q3U0P1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Palb2Q3U0P1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Palb2Q3U0P1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Palb2Q3U0P1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Palb2Q3U0P1 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Palb2Q3U0P1 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Palb2Q3U0P1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Palb2Q3U0P1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Palb2Q3U0P1 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Palb2Q3U0P1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Palb2Q3U0P1 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Palb2Q3U0P1 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Palb2Q3U0P1 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Palb2Q3U0P1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Palb2Q3U0P1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Palb2Q3U0P1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Palb2Q3U0P1 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Palb2Q3U0P1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Palb2Q3U0P1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Palb2Q3U0P1 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Palb2Q3U0P1 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Palb2Q3U0P1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Palb2Q3U0P1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Palb2Q3U0P1 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Palb2Q3U0P1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Palb2Q3U0P1 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Palb2Q3U0P1 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Palb2Q3U0P1 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Palb2Q3U0P1 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Palb2Q3U0P1 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Palb2Q3U0P1 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Palb2Q3U0P1 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Palb2Q3U0P1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Palb2Q3U0P1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Palb2Q3U0P1 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Palb2Q3U0P1 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Palb2Q3U0P1 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Palb2Q3U0P1 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Palb2Q3U0P1 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Palb2Q3U0P1 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Palb2Q3U0P1 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Palb2Q3U0P1 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Palb2Q3U0P1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Palb2Q3U0P1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Palb2Q3U0P1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Palb2Q3U0P1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Palb2Q3U0P1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Palb2Q3U0P1 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Palb2Q3U0P1 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Palb2Q3U0P1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Palb2Q3U0P1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Palb2Q3U0P1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Palb2Q3U0P1 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Palb2Q3U0P1 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Palb2Q3U0P1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Palb2Q3U0P1 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Palb2Q3U0P1 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Palb2Q3U0P1 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Palb2Q3U0P1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Palb2Q3U0P1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Palb2Q3U0P1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Palb2Q3U0P1 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Palb2Q3U0P1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Palb2Q3U0P1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Palb2Q3U0P1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Palb2Q3U0P1 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms