Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trappc9Q3U0M1 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trappc9Q3U0M1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trappc9Q3U0M1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trappc9Q3U0M1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trappc9Q3U0M1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trappc9Q3U0M1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trappc9Q3U0M1 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trappc9Q3U0M1 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trappc9Q3U0M1 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trappc9Q3U0M1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trappc9Q3U0M1 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trappc9Q3U0M1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trappc9Q3U0M1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Trappc9Q3U0M1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Trappc9Q3U0M1 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Trappc9Q3U0M1 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Trappc9Q3U0M1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Trappc9Q3U0M1 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Trappc9Q3U0M1 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Trappc9Q3U0M1 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Trappc9Q3U0M1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Trappc9Q3U0M1 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Trappc9Q3U0M1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Trappc9Q3U0M1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Trappc9Q3U0M1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Trappc9Q3U0M1 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Trappc9Q3U0M1 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Trappc9Q3U0M1 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Trappc9Q3U0M1 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Trappc9Q3U0M1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Trappc9Q3U0M1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Trappc9Q3U0M1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Trappc9Q3U0M1 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Trappc9Q3U0M1 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Trappc9Q3U0M1 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Trappc9Q3U0M1 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Trappc9Q3U0M1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Trappc9Q3U0M1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Trappc9Q3U0M1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Trappc9Q3U0M1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Trappc9Q3U0M1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Trappc9Q3U0M1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Trappc9Q3U0M1 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Trappc9Q3U0M1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Trappc9Q3U0M1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Trappc9Q3U0M1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Trappc9Q3U0M1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Trappc9Q3U0M1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Trappc9Q3U0M1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Trappc9Q3U0M1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Trappc9Q3U0M1 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Trappc9Q3U0M1 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Trappc9Q3U0M1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Trappc9Q3U0M1 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Trappc9Q3U0M1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Trappc9Q3U0M1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Trappc9Q3U0M1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Trappc9Q3U0M1 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Trappc9Q3U0M1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Trappc9Q3U0M1 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Trappc9Q3U0M1 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Trappc9Q3U0M1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Trappc9Q3U0M1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Trappc9Q3U0M1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Trappc9Q3U0M1 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Trappc9Q3U0M1 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Trappc9Q3U0M1 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Trappc9Q3U0M1 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Trappc9Q3U0M1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Trappc9Q3U0M1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Trappc9Q3U0M1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Trappc9Q3U0M1 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Trappc9Q3U0M1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Trappc9Q3U0M1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Trappc9Q3U0M1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Trappc9Q3U0M1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Trappc9Q3U0M1 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Trappc9Q3U0M1 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Trappc9Q3U0M1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Trappc9Q3U0M1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Trappc9Q3U0M1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Trappc9Q3U0M1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trappc9Q3U0M1 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trappc9Q3U0M1 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trappc9Q3U0M1 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trappc9Q3U0M1 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trappc9Q3U0M1 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trappc9Q3U0M1 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trappc9Q3U0M1 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trappc9Q3U0M1 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trappc9Q3U0M1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trappc9Q3U0M1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trappc9Q3U0M1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trappc9Q3U0M1 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trappc9Q3U0M1 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trappc9Q3U0M1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trappc9Q3U0M1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trappc9Q3U0M1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trappc9Q3U0M1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms