Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0I6

Smim6, MCG148180, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim6Q3U0I6 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smim6Q3U0I6 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smim6Q3U0I6 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smim6Q3U0I6 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Smim6Q3U0I6 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smim6Q3U0I6 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smim6Q3U0I6 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Smim6Q3U0I6 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smim6Q3U0I6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smim6Q3U0I6 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smim6Q3U0I6 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smim6Q3U0I6 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Smim6Q3U0I6 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smim6Q3U0I6 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smim6Q3U0I6 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smim6Q3U0I6 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smim6Q3U0I6 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smim6Q3U0I6 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smim6Q3U0I6 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smim6Q3U0I6 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smim6Q3U0I6 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smim6Q3U0I6 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smim6Q3U0I6 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smim6Q3U0I6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smim6Q3U0I6 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smim6Q3U0I6 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smim6Q3U0I6 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smim6Q3U0I6 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smim6Q3U0I6 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smim6Q3U0I6 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smim6Q3U0I6 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smim6Q3U0I6 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim6Q3U0I6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim6Q3U0I6 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim6Q3U0I6 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim6Q3U0I6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim6Q3U0I6 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim6Q3U0I6 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim6Q3U0I6 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim6Q3U0I6 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim6Q3U0I6 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim6Q3U0I6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim6Q3U0I6 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim6Q3U0I6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim6Q3U0I6 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim6Q3U0I6 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim6Q3U0I6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim6Q3U0I6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim6Q3U0I6 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim6Q3U0I6 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim6Q3U0I6 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim6Q3U0I6 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim6Q3U0I6 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim6Q3U0I6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim6Q3U0I6 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim6Q3U0I6 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim6Q3U0I6 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim6Q3U0I6 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim6Q3U0I6 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim6Q3U0I6 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim6Q3U0I6 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim6Q3U0I6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim6Q3U0I6 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim6Q3U0I6 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim6Q3U0I6 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim6Q3U0I6 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim6Q3U0I6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim6Q3U0I6 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim6Q3U0I6 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim6Q3U0I6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim6Q3U0I6 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim6Q3U0I6 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim6Q3U0I6 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim6Q3U0I6 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smim6Q3U0I6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smim6Q3U0I6 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smim6Q3U0I6 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smim6Q3U0I6 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smim6Q3U0I6 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smim6Q3U0I6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smim6Q3U0I6 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smim6Q3U0I6 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smim6Q3U0I6 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smim6Q3U0I6 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smim6Q3U0I6 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim6Q3U0I6 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim6Q3U0I6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim6Q3U0I6 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim6Q3U0I6 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim6Q3U0I6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim6Q3U0I6 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim6Q3U0I6 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim6Q3U0I6 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim6Q3U0I6 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim6Q3U0I6 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim6Q3U0I6 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim6Q3U0I6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim6Q3U0I6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim6Q3U0I6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim6Q3U0I6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms