Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYP4

Tmem88b, Transmembrane protein 88B, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem88bQ3TYP4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem88bQ3TYP4 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem88bQ3TYP4 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem88bQ3TYP4 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem88bQ3TYP4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem88bQ3TYP4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem88bQ3TYP4 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem88bQ3TYP4 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem88bQ3TYP4 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem88bQ3TYP4 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem88bQ3TYP4 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem88bQ3TYP4 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem88bQ3TYP4 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem88bQ3TYP4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem88bQ3TYP4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem88bQ3TYP4 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem88bQ3TYP4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem88bQ3TYP4 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem88bQ3TYP4 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem88bQ3TYP4 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem88bQ3TYP4 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem88bQ3TYP4 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem88bQ3TYP4 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem88bQ3TYP4 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem88bQ3TYP4 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem88bQ3TYP4 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem88bQ3TYP4 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tmem88bQ3TYP4 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem88bQ3TYP4 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem88bQ3TYP4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem88bQ3TYP4 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem88bQ3TYP4 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem88bQ3TYP4 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem88bQ3TYP4 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem88bQ3TYP4 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem88bQ3TYP4 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem88bQ3TYP4 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem88bQ3TYP4 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem88bQ3TYP4 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem88bQ3TYP4 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem88bQ3TYP4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem88bQ3TYP4 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem88bQ3TYP4 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem88bQ3TYP4 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem88bQ3TYP4 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem88bQ3TYP4 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem88bQ3TYP4 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem88bQ3TYP4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem88bQ3TYP4 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem88bQ3TYP4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem88bQ3TYP4 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem88bQ3TYP4 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem88bQ3TYP4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem88bQ3TYP4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem88bQ3TYP4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem88bQ3TYP4 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem88bQ3TYP4 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem88bQ3TYP4 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem88bQ3TYP4 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem88bQ3TYP4 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem88bQ3TYP4 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem88bQ3TYP4 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem88bQ3TYP4 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem88bQ3TYP4 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem88bQ3TYP4 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem88bQ3TYP4 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem88bQ3TYP4 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem88bQ3TYP4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem88bQ3TYP4 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem88bQ3TYP4 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem88bQ3TYP4 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem88bQ3TYP4 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem88bQ3TYP4 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem88bQ3TYP4 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem88bQ3TYP4 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem88bQ3TYP4 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem88bQ3TYP4 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem88bQ3TYP4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem88bQ3TYP4 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem88bQ3TYP4 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem88bQ3TYP4 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem88bQ3TYP4 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem88bQ3TYP4 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem88bQ3TYP4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem88bQ3TYP4 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem88bQ3TYP4 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem88bQ3TYP4 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem88bQ3TYP4 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem88bQ3TYP4 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem88bQ3TYP4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem88bQ3TYP4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem88bQ3TYP4 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem88bQ3TYP4 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem88bQ3TYP4 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem88bQ3TYP4 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem88bQ3TYP4 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem88bQ3TYP4 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem88bQ3TYP4 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem88bQ3TYP4 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem88bQ3TYP4 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms