Protein–RNA interactions for Protein: Q3TXS7

Psmd1, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd1Q3TXS7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Psmd1Q3TXS7 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Psmd1Q3TXS7 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Psmd1Q3TXS7 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Psmd1Q3TXS7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Psmd1Q3TXS7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Psmd1Q3TXS7 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Psmd1Q3TXS7 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Psmd1Q3TXS7 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Psmd1Q3TXS7 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Psmd1Q3TXS7 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Psmd1Q3TXS7 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Psmd1Q3TXS7 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Psmd1Q3TXS7 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Psmd1Q3TXS7 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Psmd1Q3TXS7 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Psmd1Q3TXS7 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Psmd1Q3TXS7 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Psmd1Q3TXS7 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Psmd1Q3TXS7 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Psmd1Q3TXS7 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Psmd1Q3TXS7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Psmd1Q3TXS7 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Psmd1Q3TXS7 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Psmd1Q3TXS7 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Psmd1Q3TXS7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Psmd1Q3TXS7 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Psmd1Q3TXS7 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Psmd1Q3TXS7 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Psmd1Q3TXS7 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Psmd1Q3TXS7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Psmd1Q3TXS7 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Psmd1Q3TXS7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Psmd1Q3TXS7 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Psmd1Q3TXS7 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Psmd1Q3TXS7 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Psmd1Q3TXS7 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Psmd1Q3TXS7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Psmd1Q3TXS7 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Psmd1Q3TXS7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Psmd1Q3TXS7 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Psmd1Q3TXS7 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Psmd1Q3TXS7 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Psmd1Q3TXS7 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Psmd1Q3TXS7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Psmd1Q3TXS7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Psmd1Q3TXS7 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Psmd1Q3TXS7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Psmd1Q3TXS7 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Psmd1Q3TXS7 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Psmd1Q3TXS7 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Psmd1Q3TXS7 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Psmd1Q3TXS7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Psmd1Q3TXS7 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Psmd1Q3TXS7 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Psmd1Q3TXS7 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Psmd1Q3TXS7 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Psmd1Q3TXS7 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Psmd1Q3TXS7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Psmd1Q3TXS7 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Psmd1Q3TXS7 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Psmd1Q3TXS7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Psmd1Q3TXS7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Psmd1Q3TXS7 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Psmd1Q3TXS7 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Psmd1Q3TXS7 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Psmd1Q3TXS7 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Psmd1Q3TXS7 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Psmd1Q3TXS7 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Psmd1Q3TXS7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Psmd1Q3TXS7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Psmd1Q3TXS7 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Psmd1Q3TXS7 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Psmd1Q3TXS7 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Psmd1Q3TXS7 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Psmd1Q3TXS7 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Psmd1Q3TXS7 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Psmd1Q3TXS7 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Psmd1Q3TXS7 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Psmd1Q3TXS7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Psmd1Q3TXS7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Psmd1Q3TXS7 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Psmd1Q3TXS7 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Psmd1Q3TXS7 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Psmd1Q3TXS7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Psmd1Q3TXS7 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Psmd1Q3TXS7 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Psmd1Q3TXS7 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Psmd1Q3TXS7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Psmd1Q3TXS7 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Psmd1Q3TXS7 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Psmd1Q3TXS7 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Psmd1Q3TXS7 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Psmd1Q3TXS7 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Psmd1Q3TXS7 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Psmd1Q3TXS7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Psmd1Q3TXS7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Psmd1Q3TXS7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Psmd1Q3TXS7 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Psmd1Q3TXS7 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms