Protein–RNA interactions for Protein: Q3TX08

Trmt1, tRNA (guanine(26)-N(2))-dimethyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt1Q3TX08 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trmt1Q3TX08 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trmt1Q3TX08 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trmt1Q3TX08 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Trmt1Q3TX08 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trmt1Q3TX08 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trmt1Q3TX08 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trmt1Q3TX08 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trmt1Q3TX08 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trmt1Q3TX08 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trmt1Q3TX08 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trmt1Q3TX08 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Trmt1Q3TX08 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trmt1Q3TX08 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trmt1Q3TX08 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trmt1Q3TX08 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trmt1Q3TX08 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trmt1Q3TX08 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trmt1Q3TX08 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trmt1Q3TX08 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Trmt1Q3TX08 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trmt1Q3TX08 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trmt1Q3TX08 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trmt1Q3TX08 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trmt1Q3TX08 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trmt1Q3TX08 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trmt1Q3TX08 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trmt1Q3TX08 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trmt1Q3TX08 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trmt1Q3TX08 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trmt1Q3TX08 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trmt1Q3TX08 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trmt1Q3TX08 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trmt1Q3TX08 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trmt1Q3TX08 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trmt1Q3TX08 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trmt1Q3TX08 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trmt1Q3TX08 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trmt1Q3TX08 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trmt1Q3TX08 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trmt1Q3TX08 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trmt1Q3TX08 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trmt1Q3TX08 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Trmt1Q3TX08 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Trmt1Q3TX08 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Trmt1Q3TX08 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Trmt1Q3TX08 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trmt1Q3TX08 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trmt1Q3TX08 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trmt1Q3TX08 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trmt1Q3TX08 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trmt1Q3TX08 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trmt1Q3TX08 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trmt1Q3TX08 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trmt1Q3TX08 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trmt1Q3TX08 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trmt1Q3TX08 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trmt1Q3TX08 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trmt1Q3TX08 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trmt1Q3TX08 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Trmt1Q3TX08 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trmt1Q3TX08 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trmt1Q3TX08 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trmt1Q3TX08 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trmt1Q3TX08 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trmt1Q3TX08 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Trmt1Q3TX08 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trmt1Q3TX08 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Trmt1Q3TX08 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trmt1Q3TX08 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trmt1Q3TX08 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trmt1Q3TX08 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trmt1Q3TX08 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trmt1Q3TX08 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trmt1Q3TX08 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trmt1Q3TX08 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trmt1Q3TX08 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trmt1Q3TX08 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trmt1Q3TX08 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trmt1Q3TX08 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trmt1Q3TX08 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trmt1Q3TX08 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Trmt1Q3TX08 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trmt1Q3TX08 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Trmt1Q3TX08 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trmt1Q3TX08 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trmt1Q3TX08 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trmt1Q3TX08 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trmt1Q3TX08 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trmt1Q3TX08 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trmt1Q3TX08 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trmt1Q3TX08 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trmt1Q3TX08 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trmt1Q3TX08 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trmt1Q3TX08 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trmt1Q3TX08 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Trmt1Q3TX08 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trmt1Q3TX08 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trmt1Q3TX08 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Trmt1Q3TX08 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms