Protein–RNA interactions for Protein: Q3TR08

Fndc4, Fibronectin type III domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc4Q3TR08 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fndc4Q3TR08 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fndc4Q3TR08 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fndc4Q3TR08 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fndc4Q3TR08 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fndc4Q3TR08 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Fndc4Q3TR08 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Fndc4Q3TR08 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Fndc4Q3TR08 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Fndc4Q3TR08 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Fndc4Q3TR08 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fndc4Q3TR08 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fndc4Q3TR08 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fndc4Q3TR08 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fndc4Q3TR08 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fndc4Q3TR08 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fndc4Q3TR08 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Fndc4Q3TR08 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fndc4Q3TR08 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fndc4Q3TR08 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fndc4Q3TR08 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fndc4Q3TR08 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fndc4Q3TR08 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fndc4Q3TR08 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fndc4Q3TR08 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fndc4Q3TR08 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Fndc4Q3TR08 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fndc4Q3TR08 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fndc4Q3TR08 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fndc4Q3TR08 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fndc4Q3TR08 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fndc4Q3TR08 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Fndc4Q3TR08 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fndc4Q3TR08 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Fndc4Q3TR08 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fndc4Q3TR08 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fndc4Q3TR08 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Fndc4Q3TR08 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Fndc4Q3TR08 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fndc4Q3TR08 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fndc4Q3TR08 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fndc4Q3TR08 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fndc4Q3TR08 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fndc4Q3TR08 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fndc4Q3TR08 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fndc4Q3TR08 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fndc4Q3TR08 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fndc4Q3TR08 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fndc4Q3TR08 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fndc4Q3TR08 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fndc4Q3TR08 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fndc4Q3TR08 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fndc4Q3TR08 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fndc4Q3TR08 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fndc4Q3TR08 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Fndc4Q3TR08 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fndc4Q3TR08 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fndc4Q3TR08 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fndc4Q3TR08 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fndc4Q3TR08 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fndc4Q3TR08 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fndc4Q3TR08 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fndc4Q3TR08 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fndc4Q3TR08 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fndc4Q3TR08 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fndc4Q3TR08 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fndc4Q3TR08 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fndc4Q3TR08 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fndc4Q3TR08 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fndc4Q3TR08 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fndc4Q3TR08 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fndc4Q3TR08 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Fndc4Q3TR08 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Fndc4Q3TR08 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fndc4Q3TR08 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fndc4Q3TR08 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fndc4Q3TR08 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fndc4Q3TR08 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fndc4Q3TR08 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fndc4Q3TR08 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fndc4Q3TR08 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fndc4Q3TR08 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fndc4Q3TR08 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fndc4Q3TR08 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fndc4Q3TR08 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fndc4Q3TR08 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fndc4Q3TR08 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fndc4Q3TR08 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fndc4Q3TR08 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fndc4Q3TR08 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Fndc4Q3TR08 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Fndc4Q3TR08 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Fndc4Q3TR08 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fndc4Q3TR08 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fndc4Q3TR08 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fndc4Q3TR08 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fndc4Q3TR08 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fndc4Q3TR08 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fndc4Q3TR08 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fndc4Q3TR08 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms