Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trappc13Q3TIR1 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trappc13Q3TIR1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trappc13Q3TIR1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trappc13Q3TIR1 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trappc13Q3TIR1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trappc13Q3TIR1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trappc13Q3TIR1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trappc13Q3TIR1 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trappc13Q3TIR1 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trappc13Q3TIR1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trappc13Q3TIR1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trappc13Q3TIR1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trappc13Q3TIR1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trappc13Q3TIR1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trappc13Q3TIR1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trappc13Q3TIR1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trappc13Q3TIR1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trappc13Q3TIR1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trappc13Q3TIR1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trappc13Q3TIR1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trappc13Q3TIR1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trappc13Q3TIR1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trappc13Q3TIR1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trappc13Q3TIR1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trappc13Q3TIR1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trappc13Q3TIR1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trappc13Q3TIR1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trappc13Q3TIR1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trappc13Q3TIR1 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trappc13Q3TIR1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trappc13Q3TIR1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trappc13Q3TIR1 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trappc13Q3TIR1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc13Q3TIR1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc13Q3TIR1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc13Q3TIR1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc13Q3TIR1 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc13Q3TIR1 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc13Q3TIR1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc13Q3TIR1 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc13Q3TIR1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc13Q3TIR1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc13Q3TIR1 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc13Q3TIR1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc13Q3TIR1 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc13Q3TIR1 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc13Q3TIR1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc13Q3TIR1 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc13Q3TIR1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc13Q3TIR1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc13Q3TIR1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trappc13Q3TIR1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trappc13Q3TIR1 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trappc13Q3TIR1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trappc13Q3TIR1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trappc13Q3TIR1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trappc13Q3TIR1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Trappc13Q3TIR1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trappc13Q3TIR1 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trappc13Q3TIR1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trappc13Q3TIR1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Trappc13Q3TIR1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trappc13Q3TIR1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trappc13Q3TIR1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Trappc13Q3TIR1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trappc13Q3TIR1 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trappc13Q3TIR1 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trappc13Q3TIR1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trappc13Q3TIR1 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trappc13Q3TIR1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trappc13Q3TIR1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trappc13Q3TIR1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trappc13Q3TIR1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trappc13Q3TIR1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Trappc13Q3TIR1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trappc13Q3TIR1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trappc13Q3TIR1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trappc13Q3TIR1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trappc13Q3TIR1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trappc13Q3TIR1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trappc13Q3TIR1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trappc13Q3TIR1 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trappc13Q3TIR1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trappc13Q3TIR1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trappc13Q3TIR1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Trappc13Q3TIR1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Trappc13Q3TIR1 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trappc13Q3TIR1 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trappc13Q3TIR1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trappc13Q3TIR1 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Trappc13Q3TIR1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trappc13Q3TIR1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trappc13Q3TIR1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trappc13Q3TIR1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trappc13Q3TIR1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trappc13Q3TIR1 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trappc13Q3TIR1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trappc13Q3TIR1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trappc13Q3TIR1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.5 ms