Protein–RNA interactions for Protein: Q3TD16

Rubcnl, Protein RUBCNL-like, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RubcnlQ3TD16 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RubcnlQ3TD16 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RubcnlQ3TD16 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RubcnlQ3TD16 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RubcnlQ3TD16 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RubcnlQ3TD16 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RubcnlQ3TD16 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
RubcnlQ3TD16 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RubcnlQ3TD16 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RubcnlQ3TD16 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RubcnlQ3TD16 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RubcnlQ3TD16 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RubcnlQ3TD16 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RubcnlQ3TD16 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RubcnlQ3TD16 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RubcnlQ3TD16 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RubcnlQ3TD16 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RubcnlQ3TD16 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RubcnlQ3TD16 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RubcnlQ3TD16 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RubcnlQ3TD16 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RubcnlQ3TD16 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RubcnlQ3TD16 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RubcnlQ3TD16 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RubcnlQ3TD16 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RubcnlQ3TD16 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RubcnlQ3TD16 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RubcnlQ3TD16 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RubcnlQ3TD16 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RubcnlQ3TD16 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RubcnlQ3TD16 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RubcnlQ3TD16 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RubcnlQ3TD16 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RubcnlQ3TD16 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RubcnlQ3TD16 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RubcnlQ3TD16 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RubcnlQ3TD16 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RubcnlQ3TD16 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RubcnlQ3TD16 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RubcnlQ3TD16 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RubcnlQ3TD16 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RubcnlQ3TD16 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RubcnlQ3TD16 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RubcnlQ3TD16 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RubcnlQ3TD16 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RubcnlQ3TD16 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RubcnlQ3TD16 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RubcnlQ3TD16 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RubcnlQ3TD16 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RubcnlQ3TD16 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RubcnlQ3TD16 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RubcnlQ3TD16 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RubcnlQ3TD16 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
RubcnlQ3TD16 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RubcnlQ3TD16 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RubcnlQ3TD16 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RubcnlQ3TD16 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RubcnlQ3TD16 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RubcnlQ3TD16 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RubcnlQ3TD16 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RubcnlQ3TD16 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RubcnlQ3TD16 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RubcnlQ3TD16 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RubcnlQ3TD16 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RubcnlQ3TD16 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RubcnlQ3TD16 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RubcnlQ3TD16 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RubcnlQ3TD16 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RubcnlQ3TD16 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RubcnlQ3TD16 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RubcnlQ3TD16 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RubcnlQ3TD16 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RubcnlQ3TD16 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RubcnlQ3TD16 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RubcnlQ3TD16 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
RubcnlQ3TD16 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RubcnlQ3TD16 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RubcnlQ3TD16 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RubcnlQ3TD16 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RubcnlQ3TD16 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RubcnlQ3TD16 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RubcnlQ3TD16 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RubcnlQ3TD16 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RubcnlQ3TD16 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RubcnlQ3TD16 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RubcnlQ3TD16 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RubcnlQ3TD16 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RubcnlQ3TD16 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RubcnlQ3TD16 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RubcnlQ3TD16 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RubcnlQ3TD16 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RubcnlQ3TD16 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RubcnlQ3TD16 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RubcnlQ3TD16 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RubcnlQ3TD16 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RubcnlQ3TD16 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RubcnlQ3TD16 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RubcnlQ3TD16 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RubcnlQ3TD16 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
RubcnlQ3TD16 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms