Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCJ8

Ccdc69, Coiled-coil domain-containing protein 69, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc69Q3TCJ8 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc69Q3TCJ8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc69Q3TCJ8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc69Q3TCJ8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc69Q3TCJ8 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc69Q3TCJ8 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc69Q3TCJ8 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc69Q3TCJ8 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc69Q3TCJ8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc69Q3TCJ8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc69Q3TCJ8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc69Q3TCJ8 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc69Q3TCJ8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc69Q3TCJ8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc69Q3TCJ8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc69Q3TCJ8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc69Q3TCJ8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc69Q3TCJ8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc69Q3TCJ8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc69Q3TCJ8 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc69Q3TCJ8 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc69Q3TCJ8 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc69Q3TCJ8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc69Q3TCJ8 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc69Q3TCJ8 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc69Q3TCJ8 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc69Q3TCJ8 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc69Q3TCJ8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc69Q3TCJ8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc69Q3TCJ8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc69Q3TCJ8 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc69Q3TCJ8 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc69Q3TCJ8 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc69Q3TCJ8 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc69Q3TCJ8 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc69Q3TCJ8 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc69Q3TCJ8 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc69Q3TCJ8 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc69Q3TCJ8 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc69Q3TCJ8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc69Q3TCJ8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc69Q3TCJ8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc69Q3TCJ8 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc69Q3TCJ8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc69Q3TCJ8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc69Q3TCJ8 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc69Q3TCJ8 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc69Q3TCJ8 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc69Q3TCJ8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc69Q3TCJ8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc69Q3TCJ8 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc69Q3TCJ8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc69Q3TCJ8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc69Q3TCJ8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc69Q3TCJ8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc69Q3TCJ8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc69Q3TCJ8 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc69Q3TCJ8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc69Q3TCJ8 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc69Q3TCJ8 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc69Q3TCJ8 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc69Q3TCJ8 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc69Q3TCJ8 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc69Q3TCJ8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc69Q3TCJ8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc69Q3TCJ8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc69Q3TCJ8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc69Q3TCJ8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc69Q3TCJ8 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc69Q3TCJ8 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc69Q3TCJ8 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc69Q3TCJ8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc69Q3TCJ8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc69Q3TCJ8 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc69Q3TCJ8 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc69Q3TCJ8 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc69Q3TCJ8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc69Q3TCJ8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc69Q3TCJ8 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc69Q3TCJ8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc69Q3TCJ8 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc69Q3TCJ8 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc69Q3TCJ8 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc69Q3TCJ8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc69Q3TCJ8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc69Q3TCJ8 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc69Q3TCJ8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc69Q3TCJ8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc69Q3TCJ8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc69Q3TCJ8 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc69Q3TCJ8 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc69Q3TCJ8 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc69Q3TCJ8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc69Q3TCJ8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc69Q3TCJ8 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc69Q3TCJ8 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc69Q3TCJ8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc69Q3TCJ8 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc69Q3TCJ8 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc69Q3TCJ8 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.4 ms