Protein–RNA interactions for Protein: Q3TA59

Jmjd8, JmjC domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd8Q3TA59 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Jmjd8Q3TA59 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Jmjd8Q3TA59 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Jmjd8Q3TA59 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Jmjd8Q3TA59 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Jmjd8Q3TA59 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Jmjd8Q3TA59 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Jmjd8Q3TA59 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Jmjd8Q3TA59 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Jmjd8Q3TA59 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Jmjd8Q3TA59 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Jmjd8Q3TA59 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Jmjd8Q3TA59 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Jmjd8Q3TA59 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Jmjd8Q3TA59 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Jmjd8Q3TA59 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Jmjd8Q3TA59 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Jmjd8Q3TA59 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Jmjd8Q3TA59 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Jmjd8Q3TA59 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Jmjd8Q3TA59 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Jmjd8Q3TA59 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Jmjd8Q3TA59 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Jmjd8Q3TA59 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Jmjd8Q3TA59 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Jmjd8Q3TA59 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Jmjd8Q3TA59 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Jmjd8Q3TA59 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Jmjd8Q3TA59 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Jmjd8Q3TA59 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Jmjd8Q3TA59 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Jmjd8Q3TA59 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Jmjd8Q3TA59 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Jmjd8Q3TA59 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Jmjd8Q3TA59 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Jmjd8Q3TA59 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Jmjd8Q3TA59 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Jmjd8Q3TA59 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Jmjd8Q3TA59 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Jmjd8Q3TA59 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Jmjd8Q3TA59 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Jmjd8Q3TA59 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Jmjd8Q3TA59 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Jmjd8Q3TA59 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Jmjd8Q3TA59 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Jmjd8Q3TA59 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Jmjd8Q3TA59 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Jmjd8Q3TA59 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Jmjd8Q3TA59 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Jmjd8Q3TA59 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Jmjd8Q3TA59 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Jmjd8Q3TA59 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Jmjd8Q3TA59 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Jmjd8Q3TA59 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Jmjd8Q3TA59 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Jmjd8Q3TA59 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Jmjd8Q3TA59 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Jmjd8Q3TA59 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Jmjd8Q3TA59 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Jmjd8Q3TA59 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Jmjd8Q3TA59 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Jmjd8Q3TA59 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Jmjd8Q3TA59 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Jmjd8Q3TA59 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Jmjd8Q3TA59 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Jmjd8Q3TA59 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Jmjd8Q3TA59 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Jmjd8Q3TA59 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Jmjd8Q3TA59 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Jmjd8Q3TA59 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Jmjd8Q3TA59 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Jmjd8Q3TA59 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Jmjd8Q3TA59 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Jmjd8Q3TA59 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Jmjd8Q3TA59 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Jmjd8Q3TA59 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Jmjd8Q3TA59 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Jmjd8Q3TA59 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Jmjd8Q3TA59 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Jmjd8Q3TA59 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Jmjd8Q3TA59 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Jmjd8Q3TA59 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Jmjd8Q3TA59 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Jmjd8Q3TA59 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Jmjd8Q3TA59 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Jmjd8Q3TA59 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Jmjd8Q3TA59 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Jmjd8Q3TA59 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Jmjd8Q3TA59 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Jmjd8Q3TA59 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Jmjd8Q3TA59 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Jmjd8Q3TA59 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Jmjd8Q3TA59 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Jmjd8Q3TA59 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Jmjd8Q3TA59 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Jmjd8Q3TA59 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Jmjd8Q3TA59 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Jmjd8Q3TA59 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Jmjd8Q3TA59 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Jmjd8Q3TA59 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms