Protein–RNA interactions for Protein: Q2TV84

Trpm1, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm1Q2TV84 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Trpm1Q2TV84 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Trpm1Q2TV84 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Trpm1Q2TV84 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Trpm1Q2TV84 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Trpm1Q2TV84 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Trpm1Q2TV84 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Trpm1Q2TV84 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Trpm1Q2TV84 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Trpm1Q2TV84 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Trpm1Q2TV84 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Trpm1Q2TV84 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Trpm1Q2TV84 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Trpm1Q2TV84 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Trpm1Q2TV84 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Trpm1Q2TV84 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Trpm1Q2TV84 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Trpm1Q2TV84 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Trpm1Q2TV84 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Trpm1Q2TV84 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Trpm1Q2TV84 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Trpm1Q2TV84 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Trpm1Q2TV84 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Trpm1Q2TV84 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Trpm1Q2TV84 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Trpm1Q2TV84 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Trpm1Q2TV84 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Trpm1Q2TV84 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Trpm1Q2TV84 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Trpm1Q2TV84 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Trpm1Q2TV84 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Trpm1Q2TV84 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Trpm1Q2TV84 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Trpm1Q2TV84 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Trpm1Q2TV84 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Trpm1Q2TV84 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Trpm1Q2TV84 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Trpm1Q2TV84 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Trpm1Q2TV84 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Trpm1Q2TV84 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Trpm1Q2TV84 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Trpm1Q2TV84 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Trpm1Q2TV84 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Trpm1Q2TV84 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Trpm1Q2TV84 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Trpm1Q2TV84 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Trpm1Q2TV84 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Trpm1Q2TV84 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Trpm1Q2TV84 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Trpm1Q2TV84 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Trpm1Q2TV84 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Trpm1Q2TV84 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Trpm1Q2TV84 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Trpm1Q2TV84 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Trpm1Q2TV84 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Trpm1Q2TV84 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Trpm1Q2TV84 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Trpm1Q2TV84 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Trpm1Q2TV84 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Trpm1Q2TV84 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Trpm1Q2TV84 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Trpm1Q2TV84 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Trpm1Q2TV84 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Trpm1Q2TV84 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Trpm1Q2TV84 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Trpm1Q2TV84 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Trpm1Q2TV84 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Trpm1Q2TV84 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Trpm1Q2TV84 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Trpm1Q2TV84 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Trpm1Q2TV84 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Trpm1Q2TV84 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Trpm1Q2TV84 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Trpm1Q2TV84 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Trpm1Q2TV84 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Trpm1Q2TV84 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Trpm1Q2TV84 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Trpm1Q2TV84 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Trpm1Q2TV84 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Trpm1Q2TV84 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Trpm1Q2TV84 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Trpm1Q2TV84 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Trpm1Q2TV84 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Trpm1Q2TV84 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Trpm1Q2TV84 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Trpm1Q2TV84 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Trpm1Q2TV84 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Trpm1Q2TV84 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Trpm1Q2TV84 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Trpm1Q2TV84 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Trpm1Q2TV84 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Trpm1Q2TV84 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Trpm1Q2TV84 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Trpm1Q2TV84 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Trpm1Q2TV84 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Trpm1Q2TV84 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Trpm1Q2TV84 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Trpm1Q2TV84 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Trpm1Q2TV84 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Trpm1Q2TV84 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms