Protein–RNA interactions for Protein: Q1ERP8

Cd300lg, CMRF35-like molecule 9, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300lgQ1ERP8 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cd300lgQ1ERP8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cd300lgQ1ERP8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cd300lgQ1ERP8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cd300lgQ1ERP8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cd300lgQ1ERP8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cd300lgQ1ERP8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cd300lgQ1ERP8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cd300lgQ1ERP8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cd300lgQ1ERP8 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cd300lgQ1ERP8 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cd300lgQ1ERP8 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cd300lgQ1ERP8 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cd300lgQ1ERP8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cd300lgQ1ERP8 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cd300lgQ1ERP8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cd300lgQ1ERP8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cd300lgQ1ERP8 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cd300lgQ1ERP8 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cd300lgQ1ERP8 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cd300lgQ1ERP8 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cd300lgQ1ERP8 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cd300lgQ1ERP8 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cd300lgQ1ERP8 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cd300lgQ1ERP8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cd300lgQ1ERP8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cd300lgQ1ERP8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cd300lgQ1ERP8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cd300lgQ1ERP8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cd300lgQ1ERP8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cd300lgQ1ERP8 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cd300lgQ1ERP8 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cd300lgQ1ERP8 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Cd300lgQ1ERP8 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cd300lgQ1ERP8 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cd300lgQ1ERP8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cd300lgQ1ERP8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cd300lgQ1ERP8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cd300lgQ1ERP8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cd300lgQ1ERP8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cd300lgQ1ERP8 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cd300lgQ1ERP8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cd300lgQ1ERP8 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cd300lgQ1ERP8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cd300lgQ1ERP8 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cd300lgQ1ERP8 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cd300lgQ1ERP8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cd300lgQ1ERP8 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cd300lgQ1ERP8 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cd300lgQ1ERP8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cd300lgQ1ERP8 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cd300lgQ1ERP8 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cd300lgQ1ERP8 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cd300lgQ1ERP8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cd300lgQ1ERP8 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cd300lgQ1ERP8 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cd300lgQ1ERP8 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cd300lgQ1ERP8 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Cd300lgQ1ERP8 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cd300lgQ1ERP8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cd300lgQ1ERP8 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cd300lgQ1ERP8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cd300lgQ1ERP8 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cd300lgQ1ERP8 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cd300lgQ1ERP8 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cd300lgQ1ERP8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cd300lgQ1ERP8 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cd300lgQ1ERP8 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cd300lgQ1ERP8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cd300lgQ1ERP8 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cd300lgQ1ERP8 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cd300lgQ1ERP8 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Cd300lgQ1ERP8 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cd300lgQ1ERP8 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cd300lgQ1ERP8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cd300lgQ1ERP8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cd300lgQ1ERP8 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cd300lgQ1ERP8 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cd300lgQ1ERP8 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cd300lgQ1ERP8 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Cd300lgQ1ERP8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cd300lgQ1ERP8 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cd300lgQ1ERP8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cd300lgQ1ERP8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cd300lgQ1ERP8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cd300lgQ1ERP8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cd300lgQ1ERP8 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cd300lgQ1ERP8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cd300lgQ1ERP8 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cd300lgQ1ERP8 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cd300lgQ1ERP8 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cd300lgQ1ERP8 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cd300lgQ1ERP8 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cd300lgQ1ERP8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cd300lgQ1ERP8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cd300lgQ1ERP8 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cd300lgQ1ERP8 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cd300lgQ1ERP8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cd300lgQ1ERP8 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cd300lgQ1ERP8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms