Protein–RNA interactions for Protein: Q1A3B0

Cers3, Ceramide synthase 3, mousemouse

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Length 383 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cers3Q1A3B0 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cers3Q1A3B0 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Cers3Q1A3B0 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cers3Q1A3B0 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Cers3Q1A3B0 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cers3Q1A3B0 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cers3Q1A3B0 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cers3Q1A3B0 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cers3Q1A3B0 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cers3Q1A3B0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cers3Q1A3B0 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cers3Q1A3B0 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cers3Q1A3B0 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cers3Q1A3B0 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Cers3Q1A3B0 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cers3Q1A3B0 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cers3Q1A3B0 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cers3Q1A3B0 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cers3Q1A3B0 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cers3Q1A3B0 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cers3Q1A3B0 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cers3Q1A3B0 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cers3Q1A3B0 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cers3Q1A3B0 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Cers3Q1A3B0 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cers3Q1A3B0 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cers3Q1A3B0 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cers3Q1A3B0 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cers3Q1A3B0 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Cers3Q1A3B0 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Cers3Q1A3B0 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cers3Q1A3B0 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cers3Q1A3B0 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cers3Q1A3B0 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cers3Q1A3B0 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cers3Q1A3B0 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cers3Q1A3B0 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cers3Q1A3B0 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cers3Q1A3B0 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cers3Q1A3B0 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Cers3Q1A3B0 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cers3Q1A3B0 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cers3Q1A3B0 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Cers3Q1A3B0 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Cers3Q1A3B0 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cers3Q1A3B0 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cers3Q1A3B0 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cers3Q1A3B0 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Cers3Q1A3B0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Cers3Q1A3B0 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cers3Q1A3B0 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Cers3Q1A3B0 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cers3Q1A3B0 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cers3Q1A3B0 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cers3Q1A3B0 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cers3Q1A3B0 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cers3Q1A3B0 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cers3Q1A3B0 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cers3Q1A3B0 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cers3Q1A3B0 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cers3Q1A3B0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cers3Q1A3B0 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Cers3Q1A3B0 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cers3Q1A3B0 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cers3Q1A3B0 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cers3Q1A3B0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cers3Q1A3B0 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cers3Q1A3B0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cers3Q1A3B0 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cers3Q1A3B0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cers3Q1A3B0 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cers3Q1A3B0 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cers3Q1A3B0 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cers3Q1A3B0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cers3Q1A3B0 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cers3Q1A3B0 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cers3Q1A3B0 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cers3Q1A3B0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cers3Q1A3B0 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cers3Q1A3B0 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cers3Q1A3B0 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Cers3Q1A3B0 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cers3Q1A3B0 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cers3Q1A3B0 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cers3Q1A3B0 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cers3Q1A3B0 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cers3Q1A3B0 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cers3Q1A3B0 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cers3Q1A3B0 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cers3Q1A3B0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cers3Q1A3B0 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cers3Q1A3B0 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Cers3Q1A3B0 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cers3Q1A3B0 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cers3Q1A3B0 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cers3Q1A3B0 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cers3Q1A3B0 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cers3Q1A3B0 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cers3Q1A3B0 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Cers3Q1A3B0 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
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