Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGM9

Rtel1, Regulator of telomere elongation helicase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtel1Q0VGM9 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rtel1Q0VGM9 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rtel1Q0VGM9 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rtel1Q0VGM9 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rtel1Q0VGM9 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rtel1Q0VGM9 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rtel1Q0VGM9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rtel1Q0VGM9 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rtel1Q0VGM9 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Rtel1Q0VGM9 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rtel1Q0VGM9 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rtel1Q0VGM9 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rtel1Q0VGM9 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rtel1Q0VGM9 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rtel1Q0VGM9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rtel1Q0VGM9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rtel1Q0VGM9 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rtel1Q0VGM9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rtel1Q0VGM9 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rtel1Q0VGM9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rtel1Q0VGM9 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rtel1Q0VGM9 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rtel1Q0VGM9 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rtel1Q0VGM9 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rtel1Q0VGM9 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rtel1Q0VGM9 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rtel1Q0VGM9 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Rtel1Q0VGM9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rtel1Q0VGM9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rtel1Q0VGM9 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rtel1Q0VGM9 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rtel1Q0VGM9 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rtel1Q0VGM9 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Rtel1Q0VGM9 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rtel1Q0VGM9 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rtel1Q0VGM9 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rtel1Q0VGM9 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rtel1Q0VGM9 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rtel1Q0VGM9 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Rtel1Q0VGM9 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rtel1Q0VGM9 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rtel1Q0VGM9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Rtel1Q0VGM9 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rtel1Q0VGM9 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rtel1Q0VGM9 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rtel1Q0VGM9 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rtel1Q0VGM9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rtel1Q0VGM9 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rtel1Q0VGM9 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rtel1Q0VGM9 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rtel1Q0VGM9 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rtel1Q0VGM9 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rtel1Q0VGM9 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rtel1Q0VGM9 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rtel1Q0VGM9 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rtel1Q0VGM9 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rtel1Q0VGM9 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rtel1Q0VGM9 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Rtel1Q0VGM9 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rtel1Q0VGM9 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rtel1Q0VGM9 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Rtel1Q0VGM9 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rtel1Q0VGM9 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Rtel1Q0VGM9 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rtel1Q0VGM9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rtel1Q0VGM9 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Rtel1Q0VGM9 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rtel1Q0VGM9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rtel1Q0VGM9 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rtel1Q0VGM9 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rtel1Q0VGM9 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rtel1Q0VGM9 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rtel1Q0VGM9 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rtel1Q0VGM9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rtel1Q0VGM9 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rtel1Q0VGM9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rtel1Q0VGM9 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rtel1Q0VGM9 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rtel1Q0VGM9 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rtel1Q0VGM9 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Rtel1Q0VGM9 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rtel1Q0VGM9 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rtel1Q0VGM9 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rtel1Q0VGM9 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rtel1Q0VGM9 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rtel1Q0VGM9 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rtel1Q0VGM9 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rtel1Q0VGM9 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rtel1Q0VGM9 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rtel1Q0VGM9 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rtel1Q0VGM9 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Rtel1Q0VGM9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rtel1Q0VGM9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rtel1Q0VGM9 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rtel1Q0VGM9 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rtel1Q0VGM9 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rtel1Q0VGM9 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rtel1Q0VGM9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rtel1Q0VGM9 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rtel1Q0VGM9 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms