Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG34

4930480E11Rik, MCG52719, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930480E11RikQ0VG34 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930480E11RikQ0VG34 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930480E11RikQ0VG34 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930480E11RikQ0VG34 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930480E11RikQ0VG34 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930480E11RikQ0VG34 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930480E11RikQ0VG34 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930480E11RikQ0VG34 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930480E11RikQ0VG34 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930480E11RikQ0VG34 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
4930480E11RikQ0VG34 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
4930480E11RikQ0VG34 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
4930480E11RikQ0VG34 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
4930480E11RikQ0VG34 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
4930480E11RikQ0VG34 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
4930480E11RikQ0VG34 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
4930480E11RikQ0VG34 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
4930480E11RikQ0VG34 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
4930480E11RikQ0VG34 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
4930480E11RikQ0VG34 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930480E11RikQ0VG34 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930480E11RikQ0VG34 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930480E11RikQ0VG34 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930480E11RikQ0VG34 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930480E11RikQ0VG34 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930480E11RikQ0VG34 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930480E11RikQ0VG34 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930480E11RikQ0VG34 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930480E11RikQ0VG34 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930480E11RikQ0VG34 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930480E11RikQ0VG34 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930480E11RikQ0VG34 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930480E11RikQ0VG34 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930480E11RikQ0VG34 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930480E11RikQ0VG34 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930480E11RikQ0VG34 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930480E11RikQ0VG34 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930480E11RikQ0VG34 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930480E11RikQ0VG34 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930480E11RikQ0VG34 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930480E11RikQ0VG34 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930480E11RikQ0VG34 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930480E11RikQ0VG34 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
4930480E11RikQ0VG34 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4930480E11RikQ0VG34 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4930480E11RikQ0VG34 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4930480E11RikQ0VG34 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4930480E11RikQ0VG34 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
4930480E11RikQ0VG34 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
4930480E11RikQ0VG34 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4930480E11RikQ0VG34 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4930480E11RikQ0VG34 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
4930480E11RikQ0VG34 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
4930480E11RikQ0VG34 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4930480E11RikQ0VG34 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4930480E11RikQ0VG34 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
4930480E11RikQ0VG34 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
4930480E11RikQ0VG34 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4930480E11RikQ0VG34 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930480E11RikQ0VG34 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930480E11RikQ0VG34 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930480E11RikQ0VG34 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930480E11RikQ0VG34 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930480E11RikQ0VG34 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930480E11RikQ0VG34 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930480E11RikQ0VG34 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930480E11RikQ0VG34 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930480E11RikQ0VG34 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930480E11RikQ0VG34 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930480E11RikQ0VG34 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930480E11RikQ0VG34 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930480E11RikQ0VG34 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930480E11RikQ0VG34 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930480E11RikQ0VG34 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930480E11RikQ0VG34 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930480E11RikQ0VG34 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
4930480E11RikQ0VG34 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930480E11RikQ0VG34 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930480E11RikQ0VG34 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930480E11RikQ0VG34 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930480E11RikQ0VG34 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930480E11RikQ0VG34 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4930480E11RikQ0VG34 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4930480E11RikQ0VG34 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
4930480E11RikQ0VG34 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
4930480E11RikQ0VG34 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4930480E11RikQ0VG34 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4930480E11RikQ0VG34 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4930480E11RikQ0VG34 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4930480E11RikQ0VG34 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4930480E11RikQ0VG34 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4930480E11RikQ0VG34 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4930480E11RikQ0VG34 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4930480E11RikQ0VG34 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
4930480E11RikQ0VG34 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4930480E11RikQ0VG34 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4930480E11RikQ0VG34 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
4930480E11RikQ0VG34 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
4930480E11RikQ0VG34 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4930480E11RikQ0VG34 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms