Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atp2b3Q0VF55 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atp2b3Q0VF55 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atp2b3Q0VF55 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atp2b3Q0VF55 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atp2b3Q0VF55 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atp2b3Q0VF55 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atp2b3Q0VF55 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atp2b3Q0VF55 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atp2b3Q0VF55 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atp2b3Q0VF55 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atp2b3Q0VF55 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atp2b3Q0VF55 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Atp2b3Q0VF55 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atp2b3Q0VF55 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atp2b3Q0VF55 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atp2b3Q0VF55 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Atp2b3Q0VF55 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atp2b3Q0VF55 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atp2b3Q0VF55 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atp2b3Q0VF55 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atp2b3Q0VF55 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atp2b3Q0VF55 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atp2b3Q0VF55 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atp2b3Q0VF55 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atp2b3Q0VF55 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atp2b3Q0VF55 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atp2b3Q0VF55 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atp2b3Q0VF55 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atp2b3Q0VF55 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atp2b3Q0VF55 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atp2b3Q0VF55 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atp2b3Q0VF55 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Atp2b3Q0VF55 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atp2b3Q0VF55 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atp2b3Q0VF55 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atp2b3Q0VF55 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atp2b3Q0VF55 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atp2b3Q0VF55 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atp2b3Q0VF55 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atp2b3Q0VF55 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atp2b3Q0VF55 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atp2b3Q0VF55 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atp2b3Q0VF55 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atp2b3Q0VF55 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atp2b3Q0VF55 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atp2b3Q0VF55 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Atp2b3Q0VF55 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Atp2b3Q0VF55 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Atp2b3Q0VF55 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atp2b3Q0VF55 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atp2b3Q0VF55 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atp2b3Q0VF55 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atp2b3Q0VF55 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Atp2b3Q0VF55 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atp2b3Q0VF55 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atp2b3Q0VF55 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Atp2b3Q0VF55 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atp2b3Q0VF55 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atp2b3Q0VF55 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atp2b3Q0VF55 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atp2b3Q0VF55 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atp2b3Q0VF55 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atp2b3Q0VF55 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atp2b3Q0VF55 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atp2b3Q0VF55 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atp2b3Q0VF55 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atp2b3Q0VF55 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Atp2b3Q0VF55 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atp2b3Q0VF55 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atp2b3Q0VF55 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atp2b3Q0VF55 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atp2b3Q0VF55 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atp2b3Q0VF55 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atp2b3Q0VF55 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atp2b3Q0VF55 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atp2b3Q0VF55 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atp2b3Q0VF55 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Atp2b3Q0VF55 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atp2b3Q0VF55 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atp2b3Q0VF55 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atp2b3Q0VF55 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atp2b3Q0VF55 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atp2b3Q0VF55 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atp2b3Q0VF55 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atp2b3Q0VF55 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atp2b3Q0VF55 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atp2b3Q0VF55 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atp2b3Q0VF55 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atp2b3Q0VF55 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Atp2b3Q0VF55 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atp2b3Q0VF55 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atp2b3Q0VF55 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atp2b3Q0VF55 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atp2b3Q0VF55 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Atp2b3Q0VF55 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Atp2b3Q0VF55 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Atp2b3Q0VF55 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Atp2b3Q0VF55 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Atp2b3Q0VF55 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.4 ms